21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3752 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3752  putative lipoprotein  100 
 
 
250 aa  489  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3486  putative lipoprotein  64.59 
 
 
271 aa  280  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2411  hypothetical protein  50 
 
 
246 aa  203  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1273  putative lipoprotein  48.16 
 
 
282 aa  185  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.958512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1101  putative lipoprotein  46.5 
 
 
280 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1194  putative lipoprotein  46.5 
 
 
280 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2076  putative lipoprotein  49.2 
 
 
276 aa  172  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128092  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6128  putative lipoprotein  47.83 
 
 
305 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4640  putative lipoprotein  46.4 
 
 
277 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2330  putative lipoprotein  42.49 
 
 
244 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0461141  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1964  putative lipoprotein  48.1 
 
 
247 aa  140  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0700691  hitchhiker  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0160  putative lipoprotein  44.8 
 
 
251 aa  115  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1144  putative lipoprotein  37.8 
 
 
258 aa  95.5  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2178  hypothetical protein  31.12 
 
 
246 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0247  hypothetical protein  52 
 
 
241 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0407  2-phosphosulfolactate phosphatase  26.79 
 
 
239 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.932789  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0473  2-phosphosulfolactate phosphatase  24.55 
 
 
261 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06701  2-phosphosulfolactate phosphatase  26.27 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.284053  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2128  2-phosphosulfolactate phosphatase  30.18 
 
 
246 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.219665  normal  0.271835 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0614  2-phosphosulfolactate phosphatase  25.82 
 
 
222 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0129  2-phosphosulfolactate phosphatase  25.79 
 
 
227 aa  42.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.774772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>