18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4640 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4640  putative lipoprotein  100 
 
 
277 aa  531  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2411  hypothetical protein  51.2 
 
 
246 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3752  putative lipoprotein  46.4 
 
 
250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3486  putative lipoprotein  43.21 
 
 
271 aa  155  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6128  putative lipoprotein  44.79 
 
 
305 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1101  putative lipoprotein  43.37 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1194  putative lipoprotein  43.37 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1273  putative lipoprotein  42.63 
 
 
282 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.958512 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2076  putative lipoprotein  43.46 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128092  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2330  putative lipoprotein  36.51 
 
 
244 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0461141  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1964  putative lipoprotein  39.27 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0700691  hitchhiker  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0160  putative lipoprotein  40.32 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1144  putative lipoprotein  36.47 
 
 
258 aa  90.1  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2178  hypothetical protein  30.95 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1552  2-phosphosulfolactate phosphatase  25.74 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0247  hypothetical protein  40.38 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2076  2-phosphosulfolactate phosphatase  29.25 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3249  hypothetical protein  29.25 
 
 
244 aa  42.7  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>