26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6128 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6128  putative lipoprotein  100 
 
 
305 aa  601  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2411  hypothetical protein  51 
 
 
246 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1273  putative lipoprotein  44.4 
 
 
282 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.958512 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3752  putative lipoprotein  49.59 
 
 
250 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1194  putative lipoprotein  44.72 
 
 
280 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1101  putative lipoprotein  44.72 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2076  putative lipoprotein  48.24 
 
 
276 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128092  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3486  putative lipoprotein  45.74 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2330  putative lipoprotein  41.6 
 
 
244 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0461141  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0160  putative lipoprotein  53.28 
 
 
251 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1964  putative lipoprotein  45.53 
 
 
247 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0700691  hitchhiker  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4640  putative lipoprotein  44.79 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1144  putative lipoprotein  41.67 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2178  hypothetical protein  32.66 
 
 
246 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0247  hypothetical protein  54.72 
 
 
241 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0131  2-phosphosulfolactate phosphatase  25.45 
 
 
227 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0129  2-phosphosulfolactate phosphatase  25.45 
 
 
227 aa  55.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.774772  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0407  2-phosphosulfolactate phosphatase  25.22 
 
 
239 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.932789  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1051  2-phosphosulfolactate phosphatase  22.73 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00427368  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1805  2-phosphosulfolactate phosphatase  25.51 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191126  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1161  2-phosphosulfolactate phosphatase  20.95 
 
 
248 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.862609  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1514  2-phosphosulfolactate phosphatase  21.2 
 
 
249 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0267147  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2823  2-phosphosulfolactate phosphatase  27.04 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0789  2-phosphosulfolactate phosphatase  20.33 
 
 
249 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.567019  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0750  2-phosphosulfolactate phosphatase  30 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.158423  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2338  2-phosphosulfolactate phosphatase  27.27 
 
 
254 aa  42.7  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>