24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0160 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0160  putative lipoprotein  100 
 
 
251 aa  481  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6128  putative lipoprotein  54.1 
 
 
305 aa  199  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1273  putative lipoprotein  47.15 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.958512 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1194  putative lipoprotein  46.28 
 
 
280 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1101  putative lipoprotein  46.28 
 
 
280 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2411  hypothetical protein  45.75 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2076  putative lipoprotein  46 
 
 
276 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128092  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3752  putative lipoprotein  45.97 
 
 
250 aa  145  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1964  putative lipoprotein  45.34 
 
 
247 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0700691  hitchhiker  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2330  putative lipoprotein  40.08 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0461141  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1144  putative lipoprotein  43.13 
 
 
258 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3486  putative lipoprotein  42.53 
 
 
271 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4640  putative lipoprotein  41.73 
 
 
277 aa  119  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2178  hypothetical protein  31.75 
 
 
246 aa  60.1  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1552  2-phosphosulfolactate phosphatase  26.69 
 
 
231 aa  60.1  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0407  2-phosphosulfolactate phosphatase  26.61 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.932789  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2338  2-phosphosulfolactate phosphatase  31.86 
 
 
254 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1051  2-phosphosulfolactate phosphatase  21.62 
 
 
241 aa  48.9  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00427368  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1805  2-phosphosulfolactate phosphatase  27.68 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191126  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0247  hypothetical protein  56.82 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0129  2-phosphosulfolactate phosphatase  26.22 
 
 
227 aa  43.9  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.774772  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4549  2-phosphosulfolactate phosphatase  24.22 
 
 
236 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0131  2-phosphosulfolactate phosphatase  26.22 
 
 
227 aa  43.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4415  2-phosphosulfolactate phosphatase  23.32 
 
 
236 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587802  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>