27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2411 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2411  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  476  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3486  putative lipoprotein  49.81 
 
 
271 aa  203  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6128  putative lipoprotein  51 
 
 
305 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3752  putative lipoprotein  50 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1273  putative lipoprotein  46.09 
 
 
282 aa  174  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.958512 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4640  putative lipoprotein  51.2 
 
 
277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1194  putative lipoprotein  46.09 
 
 
280 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1101  putative lipoprotein  46.09 
 
 
280 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1964  putative lipoprotein  44.67 
 
 
247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0700691  hitchhiker  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2076  putative lipoprotein  44.05 
 
 
276 aa  145  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128092  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2330  putative lipoprotein  36.55 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0461141  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0160  putative lipoprotein  45.75 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1144  putative lipoprotein  38.7 
 
 
258 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2178  hypothetical protein  32.77 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0119  2-phosphosulfolactate phosphatase  28.99 
 
 
249 aa  59.3  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.809928 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0129  2-phosphosulfolactate phosphatase  25.69 
 
 
227 aa  56.6  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.774772  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0131  2-phosphosulfolactate phosphatase  25.35 
 
 
227 aa  56.2  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2076  2-phosphosulfolactate phosphatase  30.28 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3249  hypothetical protein  30.28 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06701  2-phosphosulfolactate phosphatase  28.44 
 
 
249 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.284053  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2823  2-phosphosulfolactate phosphatase  25.86 
 
 
234 aa  48.9  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1552  2-phosphosulfolactate phosphatase  23.85 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0597  2-phosphosulfolactate phosphatase  23.25 
 
 
242 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.543467  normal  0.916156 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0247  hypothetical protein  45.1 
 
 
241 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0407  2-phosphosulfolactate phosphatase  21.97 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.932789  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1806  2-phosphosulfolactate phosphatase  28.19 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2128  2-phosphosulfolactate phosphatase  29.03 
 
 
246 aa  43.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.219665  normal  0.271835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>