20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5052 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5052  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  775    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3197  hypothetical protein  95.57 
 
 		 384 aa  740    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4570  hypothetical protein  65.65 
 
 		 382 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.295869 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00320  hypothetical protein  47.59 
 
 		 371 aa  287  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0075  biotin carboxylase  43.62 
 
 		 381 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5069  hypothetical protein  47.25 
 
 		 388 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0903407  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2004  biotin carboxylase  46.67 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6154  biotin carboxylase  46.82 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2290  hypothetical protein  41.91 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.302126  hitchhiker  0.000035394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2225  biotin carboxylase  46.47 
 
 		 381 aa  246  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3503  hypothetical protein  41.03 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.749528  normal  0.240509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1860  hypothetical protein  43.59 
 
 		 372 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.227786  normal  0.178829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2237  hypothetical protein  40.49 
 
 		 372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3436  hypothetical protein  41.1 
 
 		 371 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.471911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3137  hypothetical protein  43.16 
 
 		 365 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5040  hypothetical protein  39.61 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.763439  decreased coverage  0.00496845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36550  hypothetical protein  45.1 
 
 		 365 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114714  normal  0.75514 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4296  hypothetical protein  37.46 
 
 		 369 aa  178  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03886  hypothetical protein  44.44 
 
 		 139 aa  99.8  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3090  putative beta-carotene desaturase/methylase  39.44 
 
 		 520 aa  43.9  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>