20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6154 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6154  biotin carboxylase  100 
 
 		 386 aa  760    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0075  biotin carboxylase  60.61 
 
 		 381 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2225  biotin carboxylase  63.93 
 
 		 381 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00320  hypothetical protein  56.15 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2004  biotin carboxylase  54.52 
 
 		 390 aa  355  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2290  hypothetical protein  49.86 
 
 		 365 aa  332  5e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.302126  hitchhiker  0.000035394 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3436  hypothetical protein  49.72 
 
 		 371 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.471911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1860  hypothetical protein  48.48 
 
 		 372 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.227786  normal  0.178829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36550  hypothetical protein  50.86 
 
 		 365 aa  299  7e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114714  normal  0.75514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3137  hypothetical protein  51.72 
 
 		 365 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4570  hypothetical protein  50.88 
 
 		 382 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.295869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3503  hypothetical protein  47.78 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.749528  normal  0.240509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5040  hypothetical protein  50.14 
 
 		 368 aa  297  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.763439  decreased coverage  0.00496845 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2237  hypothetical protein  47.22 
 
 		 372 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5069  hypothetical protein  48.94 
 
 		 388 aa  292  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0903407  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3197  hypothetical protein  47.11 
 
 		 384 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5052  hypothetical protein  46.82 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4296  hypothetical protein  38.78 
 
 		 369 aa  189  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03886  hypothetical protein  41.49 
 
 		 139 aa  70.9  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03885  hypothetical protein  42.42 
 
 		 117 aa  49.7  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>