20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3503 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2237  hypothetical protein  94.89 
 
 		 372 aa  720    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3503  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  758    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.749528  normal  0.240509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1860  hypothetical protein  88.44 
 
 		 372 aa  662    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.227786  normal  0.178829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3436  hypothetical protein  82.75 
 
 		 371 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.471911 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2290  hypothetical protein  50.14 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.302126  hitchhiker  0.000035394 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00320  hypothetical protein  49.58 
 
 		 371 aa  326  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0075  biotin carboxylase  46.74 
 
 		 381 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2004  biotin carboxylase  45.92 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6154  biotin carboxylase  47.78 
 
 		 386 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5040  hypothetical protein  45.03 
 
 		 368 aa  276  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.763439  decreased coverage  0.00496845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2225  biotin carboxylase  50.32 
 
 		 381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36550  hypothetical protein  47.21 
 
 		 365 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114714  normal  0.75514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3137  hypothetical protein  44.28 
 
 		 365 aa  258  8e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4570  hypothetical protein  43.45 
 
 		 382 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.295869 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3197  hypothetical protein  40.71 
 
 		 384 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5069  hypothetical protein  45.87 
 
 		 388 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0903407  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5052  hypothetical protein  41.03 
 
 		 384 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4296  hypothetical protein  38.53 
 
 		 369 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03886  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03885  hypothetical protein  41.67 
 
 		 117 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>