19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_00320 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_00320  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  736    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0075  biotin carboxylase  53.72 
 
 		 381 aa  362  8e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6154  biotin carboxylase  56.15 
 
 		 386 aa  350  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2225  biotin carboxylase  56.18 
 
 		 381 aa  333  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1860  hypothetical protein  51.7 
 
 		 372 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.227786  normal  0.178829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2237  hypothetical protein  50.42 
 
 		 372 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3503  hypothetical protein  49.58 
 
 		 372 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.749528  normal  0.240509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2004  biotin carboxylase  50 
 
 		 390 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3436  hypothetical protein  48.76 
 
 		 371 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.471911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3137  hypothetical protein  52.53 
 
 		 365 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36550  hypothetical protein  51.4 
 
 		 365 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114714  normal  0.75514 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2290  hypothetical protein  47.26 
 
 		 365 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.302126  hitchhiker  0.000035394 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4570  hypothetical protein  47.32 
 
 		 382 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.295869 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3197  hypothetical protein  47.89 
 
 		 384 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5040  hypothetical protein  47.34 
 
 		 368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.763439  decreased coverage  0.00496845 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5052  hypothetical protein  47.59 
 
 		 384 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5069  hypothetical protein  44.97 
 
 		 388 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0903407  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4296  hypothetical protein  38.59 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03886  hypothetical protein  35.05 
 
 		 139 aa  58.9  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>