20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5040 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5040  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  749    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.763439  decreased coverage  0.00496845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36550  hypothetical protein  54.85 
 
 		 365 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114714  normal  0.75514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3137  hypothetical protein  53.57 
 
 		 365 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0075  biotin carboxylase  47.13 
 
 		 381 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6154  biotin carboxylase  50.14 
 
 		 386 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00320  hypothetical protein  47.34 
 
 		 371 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2290  hypothetical protein  45.09 
 
 		 365 aa  296  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.302126  hitchhiker  0.000035394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1860  hypothetical protein  46.13 
 
 		 372 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.227786  normal  0.178829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2237  hypothetical protein  45.58 
 
 		 372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3503  hypothetical protein  45.03 
 
 		 372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.749528  normal  0.240509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3436  hypothetical protein  45.11 
 
 		 371 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.471911 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2004  biotin carboxylase  43.96 
 
 		 390 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2225  biotin carboxylase  46.84 
 
 		 381 aa  275  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4570  hypothetical protein  44.12 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.295869 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3197  hypothetical protein  39.61 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5069  hypothetical protein  40.37 
 
 		 388 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0903407  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5052  hypothetical protein  39.61 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4296  hypothetical protein  34.07 
 
 		 369 aa  172  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03886  hypothetical protein  32.14 
 
 		 139 aa  55.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03885  hypothetical protein  38.81 
 
 		 117 aa  47.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>