19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2237 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2237  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  758    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3503  hypothetical protein  94.89 
 
 		 372 aa  720    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.749528  normal  0.240509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1860  hypothetical protein  87.1 
 
 		 372 aa  657    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.227786  normal  0.178829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3436  hypothetical protein  81.13 
 
 		 371 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.471911 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2290  hypothetical protein  50.14 
 
 		 365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.302126  hitchhiker  0.000035394 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00320  hypothetical protein  50.42 
 
 		 371 aa  332  7.000000000000001e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0075  biotin carboxylase  45.92 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6154  biotin carboxylase  47.22 
 
 		 386 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2004  biotin carboxylase  44.6 
 
 		 390 aa  277  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5040  hypothetical protein  45.58 
 
 		 368 aa  275  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.763439  decreased coverage  0.00496845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2225  biotin carboxylase  46.13 
 
 		 381 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36550  hypothetical protein  44.13 
 
 		 365 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114714  normal  0.75514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3137  hypothetical protein  44.28 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4570  hypothetical protein  43.51 
 
 		 382 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.295869 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5069  hypothetical protein  45.78 
 
 		 388 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0903407  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3197  hypothetical protein  40.7 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5052  hypothetical protein  40.49 
 
 		 384 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4296  hypothetical protein  39.58 
 
 		 369 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03886  hypothetical protein  38.95 
 
 		 139 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>