19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_36550 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_36550  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  729    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114714  normal  0.75514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3137  hypothetical protein  88.77 
 
 		 365 aa  643    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5040  hypothetical protein  54.85 
 
 		 368 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.763439  decreased coverage  0.00496845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00320  hypothetical protein  51.4 
 
 		 371 aa  302  6.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0075  biotin carboxylase  49.27 
 
 		 381 aa  295  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6154  biotin carboxylase  50 
 
 		 386 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3436  hypothetical protein  46.11 
 
 		 371 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.471911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1860  hypothetical protein  48.2 
 
 		 372 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.227786  normal  0.178829 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2290  hypothetical protein  44.76 
 
 		 365 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.302126  hitchhiker  0.000035394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3503  hypothetical protein  47.21 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.749528  normal  0.240509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2237  hypothetical protein  44.13 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2225  biotin carboxylase  50.64 
 
 		 381 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2004  biotin carboxylase  44.01 
 
 		 390 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4570  hypothetical protein  44.8 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.295869 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3197  hypothetical protein  44.77 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5052  hypothetical protein  45.1 
 
 		 384 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5069  hypothetical protein  42.25 
 
 		 388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0903407  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4296  hypothetical protein  37.74 
 
 		 369 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03886  hypothetical protein  38.61 
 
 		 139 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>