20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5069 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5069  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  777    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0903407  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2004  biotin carboxylase  48.35 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4570  hypothetical protein  47.68 
 
 		 382 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.295869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6154  biotin carboxylase  48.94 
 
 		 386 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3197  hypothetical protein  46.7 
 
 		 384 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5052  hypothetical protein  47.25 
 
 		 384 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0075  biotin carboxylase  44.33 
 
 		 381 aa  275  8e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00320  hypothetical protein  44.97 
 
 		 371 aa  267  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2237  hypothetical protein  45.32 
 
 		 372 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1860  hypothetical protein  47.04 
 
 		 372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.227786  normal  0.178829 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3503  hypothetical protein  45.87 
 
 		 372 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.749528  normal  0.240509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2290  hypothetical protein  43.66 
 
 		 365 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.302126  hitchhiker  0.000035394 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3436  hypothetical protein  44.79 
 
 		 371 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.471911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2225  biotin carboxylase  45.73 
 
 		 381 aa  235  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5040  hypothetical protein  40.37 
 
 		 368 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.763439  decreased coverage  0.00496845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3137  hypothetical protein  43.06 
 
 		 365 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36550  hypothetical protein  42.25 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114714  normal  0.75514 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4296  hypothetical protein  40.07 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03886  hypothetical protein  45.19 
 
 		 139 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03885  hypothetical protein  42.65 
 
 		 117 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>