13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03885 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03885  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  236  5.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5069  hypothetical protein  42.65 
 
 		 388 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0903407  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2004  biotin carboxylase  37.31 
 
 		 390 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6154  biotin carboxylase  42.42 
 
 		 386 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2225  biotin carboxylase  38.46 
 
 		 381 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2290  hypothetical protein  38.1 
 
 		 365 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.302126  hitchhiker  0.000035394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0075  biotin carboxylase  37.31 
 
 		 381 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3503  hypothetical protein  41.67 
 
 		 372 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.749528  normal  0.240509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5040  hypothetical protein  41.18 
 
 		 368 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.763439  decreased coverage  0.00496845 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1860  hypothetical protein  34.21 
 
 		 372 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.227786  normal  0.178829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2237  hypothetical protein  36.67 
 
 		 372 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4570  hypothetical protein  33.33 
 
 		 382 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.295869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3436  hypothetical protein  41.51 
 
 		 371 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.471911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>