265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4651 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4651  PhzF family phenazine biosynthesis protein  100 
 
 
312 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6122  PhzF family phenazine biosynthesis protein  58.27 
 
 
290 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1309  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  56.83 
 
 
290 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6520  PhzF family phenazine biosynthesis protein  56.83 
 
 
290 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0912962  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3478  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  47.37 
 
 
289 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0695575  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2840  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.44 
 
 
290 aa  179  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  32.06 
 
 
297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3192  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.07 
 
 
285 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0850826  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  32.48 
 
 
297 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  32.85 
 
 
297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3493  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  30.07 
 
 
285 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3279  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.07 
 
 
285 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3536  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.07 
 
 
285 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3249  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.71 
 
 
285 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755296  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  31.47 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.47 
 
 
297 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  31.47 
 
 
297 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3403  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.43 
 
 
287 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000300678  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  29.52 
 
 
301 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  30.07 
 
 
297 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  30.07 
 
 
297 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  30.07 
 
 
297 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.778607 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1698  hypothetical protein  30.77 
 
 
297 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874362  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4858  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.76 
 
 
292 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0702681 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1580  hypothetical protein  30.07 
 
 
297 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3076  phenazine biosynthesis protein PhzF  28.67 
 
 
287 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.88 
 
 
285 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093254  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0582  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.63 
 
 
292 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.922039  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  29.57 
 
 
300 aa  101  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.38 
 
 
302 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2247  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  28.67 
 
 
287 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.66 
 
 
299 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.44 
 
 
278 aa  96.7  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3216  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.05 
 
 
299 aa  95.9  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3469  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.05 
 
 
299 aa  95.9  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.13144  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.14 
 
 
299 aa  95.9  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.1 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3123  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.27 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  28.57 
 
 
300 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3448  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  26.64 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3435  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.73 
 
 
299 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3114  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.64 
 
 
299 aa  93.6  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0969636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3421  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  27.03 
 
 
299 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3194  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.96 
 
 
299 aa  92.8  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.515626  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2998  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.92 
 
 
300 aa  92.4  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.562415  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0485  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.44 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1823  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  25.68 
 
 
299 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.683249  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.73 
 
 
299 aa  89.4  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.960271  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  28.62 
 
 
302 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.27 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.71 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2789  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.91 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00277552  hitchhiker  0.000013818 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3108  hypothetical protein  33.33 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1137  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.21 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.210437  normal  0.0131872 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5692  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.77 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.18 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.81 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0956  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.11 
 
 
304 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1148  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.88 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4071  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.21 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.74 
 
 
309 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2389  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.34 
 
 
293 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.14 
 
 
302 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0905  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.78 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.638343  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  25.91 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1440  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.09 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.596759  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.18 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  30.77 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  25.91 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.1 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192851 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.63 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.1 
 
 
309 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.270248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1930  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.58 
 
 
301 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.12 
 
 
307 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0750  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.95 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.707799 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2271  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.58 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3334  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.02 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1135  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.65 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125748  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  26.03 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1741  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.31 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2353  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.31 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.98 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.47 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1010  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.68 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.66 
 
 
294 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.08 
 
 
304 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1009  phenazine biosynthesis protein PhzF family  26.74 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1326  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.26 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4322  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.06 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.283976 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.84 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0551  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.57 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1662  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.3 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0926  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.42 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2046  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00628004  normal  0.447072 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1560  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.68 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.264367  normal  0.0194008 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  29.77 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.55 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10910  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.62 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.96 
 
 
265 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35973  predicted protein  29.18 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>