248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3478 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3478  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  100 
 
 
289 aa  583  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0695575  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4651  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.67 
 
 
312 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6122  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.86 
 
 
290 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1309  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  50.17 
 
 
290 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6520  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.17 
 
 
290 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0912962  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2840  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.28 
 
 
290 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2998  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.82 
 
 
300 aa  112  9e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.562415  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.54 
 
 
299 aa  105  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.25 
 
 
299 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.05 
 
 
299 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.960271  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.62 
 
 
307 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.22 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.49 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  27.69 
 
 
301 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2247  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  23.79 
 
 
287 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  29.87 
 
 
297 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3076  phenazine biosynthesis protein PhzF  23.79 
 
 
287 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1137  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.83 
 
 
295 aa  92.8  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.210437  normal  0.0131872 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  29.53 
 
 
297 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  29.53 
 
 
297 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0582  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.47 
 
 
292 aa  92  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.922039  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.53 
 
 
297 aa  92  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3279  PhzF family phenazine biosynthesis protein  24.41 
 
 
285 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  29.53 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3536  PhzF family phenazine biosynthesis protein  24.41 
 
 
285 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3493  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  24.41 
 
 
285 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3249  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  24.41 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1698  hypothetical protein  29.72 
 
 
297 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874362  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1580  hypothetical protein  29.05 
 
 
297 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3216  PhzF family phenazine biosynthesis protein  24.33 
 
 
299 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3469  PhzF family phenazine biosynthesis protein  24.33 
 
 
299 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.13144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  29.73 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3192  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  24.07 
 
 
285 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0850826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.09 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093254  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.5 
 
 
307 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  28.72 
 
 
297 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.778607 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  28.72 
 
 
297 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  24.33 
 
 
299 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1823  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  24.33 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.683249  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3123  PhzF family phenazine biosynthesis protein  24 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4858  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.26 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0702681 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  26.49 
 
 
300 aa  87.8  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  28.38 
 
 
297 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3448  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  24 
 
 
299 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3421  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  23.67 
 
 
299 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.91 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3194  PhzF family phenazine biosynthesis protein  23.67 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.515626  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.45 
 
 
299 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  28.26 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  24.09 
 
 
278 aa  84  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0485  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.55 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3114  PhzF family phenazine biosynthesis protein  24.33 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0969636  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1148  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.04 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1009  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.28 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.67 
 
 
287 aa  82  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.81 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.270248 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3435  phenazine biosynthesis protein PhzF family  23.67 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0905  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.24 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.638343  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.81 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192851 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.43 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2025  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.04 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.98196  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.47 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.91 
 
 
280 aa  77  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.84 
 
 
340 aa  75.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2880  phenazine biosynthesis protein PhzF family  26.46 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000112609  hitchhiker  0.000294886 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3403  phenazine biosynthesis protein PhzF family  22.88 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000300678  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0956  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.95 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.47 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0097  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.84 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.639097 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3108  hypothetical protein  31.08 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1440  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.32 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.596759  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6912  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.75 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2247  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.71 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1456  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.85 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02007  phenazine biosynthesis PhzF family protein  31.3 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.85 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0253  hypothetical protein  29.63 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.29 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.82 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.82 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0091  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.84 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2119  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.8 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.0423877 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.52 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22670  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.77 
 
 
304 aa  68.9  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1930  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.45 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.87 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.44 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2046  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.01 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00628004  normal  0.447072 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0821  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  28.45 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3119  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.51 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3846  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.04 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4071  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.42 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2772  phenazine antibiotic biosynthesis related protein  28.16 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0549944  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35973  predicted protein  30.54 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10910  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.06 
 
 
292 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3334  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  27.68 
 
 
305 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379921 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40 
 
 
292 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  26.42 
 
 
298 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.14 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>