24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_35973 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_35973  predicted protein  100 
 
 
317 aa  652    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1309  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.82 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6520  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.82 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0912962  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6122  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.47 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4651  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.77 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3478  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.54 
 
 
289 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0695575  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2840  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.05 
 
 
290 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3279  PhzF family phenazine biosynthesis protein  21.84 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3493  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  21.84 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3536  PhzF family phenazine biosynthesis protein  21.84 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4071  PhzF family phenazine biosynthesis protein  23.55 
 
 
288 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3192  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  21.04 
 
 
285 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0850826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3249  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  20.62 
 
 
285 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755296  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0905  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.6 
 
 
315 aa  49.3  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.638343  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  24.71 
 
 
302 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  37.04 
 
 
286 aa  46.2  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  25.53 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  19.39 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093254  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.48 
 
 
299 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3076  phenazine biosynthesis protein PhzF  19.52 
 
 
287 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.2 
 
 
276 aa  43.9  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5096  epimerase PhzC/PhzF  34.78 
 
 
289 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.487089 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2247  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  19.82 
 
 
287 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.29 
 
 
299 aa  42.4  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>