91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1654 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1654  tRNA-OTHER  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000253877  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0039  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0034  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0024  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0039  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00372537  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0037  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448716  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2759  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0341238  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1308  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.585322  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0039  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1702  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.535582  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0032  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.832737  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0562  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.60431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.592302  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1501  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.287153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1531  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.47488  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0590  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.532151  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0047  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0768  tRNA-Pro  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.28458  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0035  tRNA-Pro  95.92 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4244  normal  0.758764 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0039  tRNA-Pro  95.92 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0053  tRNA-OTHER  95.92 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0052  tRNA-Pro  95.92 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0047  tRNA-Pro  95.92 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0059  tRNA-Pro  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.867475 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0047  tRNA-Pro  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0007  tRNA-Pro  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000164382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0057  tRNA-Pro  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.125773  normal  0.0397591 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0008  tRNA-Pro  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00816895  normal  0.604163 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0062  tRNA-Pro  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0036  tRNA-Pro  95.56 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0614485  normal  0.169266 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0066  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.060249  normal  0.806885 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0016  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504484  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0050  tRNA-Pro  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0840957  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0711  tRNA-Pro  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t08  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.657243  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0025  tRNA-Pro  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1454  tRNA-Pro  91.11 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00328023  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1418  tRNA-Pro  91.11 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0002  tRNA-Pro  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00636416  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03760  tRNA-Pro  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0064  tRNA-Pro  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0018  tRNA-Pro  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2326  tRNA-Pro  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.261307  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0036  tRNA-Pro  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0002  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0041  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0010  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.475805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4311  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0048  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.793007 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0051  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293622  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0035  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0637572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0011  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0032  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0046  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0014  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0036  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0017  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tPro01  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 80 bp  50.1  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000413507  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tPro02  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 80 bp  50.1  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00984668  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0048  tRNA-Pro  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.281731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0056  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0032  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0036  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.103691  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0049  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0052  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.179946  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09780  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0646814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0050  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000306813 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0016  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.519622  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0041  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0003  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.8235300000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0029  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0043  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4575  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_002950  PGt41  tRNA-Val  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0066  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00163637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0019  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00557202  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0080  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt40  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5342  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164653  hitchhiker  0.0000000000098497 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5142  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000365086  normal  0.814719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5046  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0049  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0228  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000829583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1890  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0073  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0300  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0020  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0039  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.595409  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0152  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0127  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.615577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0100  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>