270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_tPro02 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_tPro01  tRNA-Pro  100 
 
 		 80 bp  159  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000413507  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tPro02  tRNA-Pro  100 
 
 		 80 bp  159  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00984668  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00070  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000213346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0104  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000101126  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4214  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000749562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4322  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000374213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4263  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000112218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0086  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0096  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5235  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000789982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0528  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000899305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4202  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.22322e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0099  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0002  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0110992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4160  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000214401  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4160  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0002  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4129  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.17442  normal  0.148505 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4295  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0088  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0004  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170858  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0011  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000391408  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5090  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000428942  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0045  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0152131  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0094  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000259411  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4145  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000725201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0002  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.236408  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4164  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000231631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0121  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000547539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4713  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.43285e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0006  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000337222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5233  tRNA-Pro  96.83 
 
 		 76 bp  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0016  tRNA-Pro  93.15 
 
 		 77 bp  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504484  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0184  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0007  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  87.7  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000164382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0008  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  87.7  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00816895  normal  0.604163 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0047  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  87.7  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0032  tRNA-Pro  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0051  tRNA-Pro  93.1 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0066  tRNA-Pro  91.67 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.060249  normal  0.806885 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.592302  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0032  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.832737  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0039  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1702  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.535582  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2759  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0341238  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0025  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0034  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0024  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0018  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0039  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00372537  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0037  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448716  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1308  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.585322  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0562  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.60431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1501  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.287153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1531  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.47488  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0590  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.532151  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0039  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0017  tRNA-Pro  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0097  tRNA-Pro  88.57 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0098  tRNA-Pro  88.57 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.266439  normal  0.536301 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0118  tRNA-Pro  88.57 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0573912  normal  0.387892 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5665  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000462002  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0036  tRNA-Pro  87.67 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 80 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000160288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-4  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 80 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000117481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 80 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0278  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0047  tRNA-Pro  90.16 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5043  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0300  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871515  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0071  tRNA-Pro  87.67 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000628165  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0052  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0021  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0691598 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0052  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5673  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000105967  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0035  tRNA-Pro  87.67 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0637572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3099t  tRNA-Pro  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000107843  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5725  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000708731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0102  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000658436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000771561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000195724  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3155t  tRNA-Pro  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0105  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000482088  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000342912  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3101t  tRNA-Pro  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000115103  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0037  tRNA-Pro  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217744 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5027  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000593186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5812  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000461866  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0861  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101894  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5733  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00489  tRNA-Pro  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01261  tRNA-Pro  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4570  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  normal  0.109465 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0041  tRNA-Pro  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>