22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0556 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1952  LysM domain-containing protein  99.59 
 
 		 4131 aa  8239    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1886  LysM domain-containing protein  99.44 
 
 		 2847 aa  5652    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1994  LysM domain-containing protein  97.43 
 
 		 4132 aa  7906    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0556  LysM domain-containing protein  100 
 
 		 4121 aa  8275    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2925  LysM domain-containing protein  35.53 
 
 		 3796 aa  1088    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0649  LysM domain-containing protein  99.1 
 
 		 4131 aa  8193    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0917  LysM domain-containing protein  99.44 
 
 		 2847 aa  5652    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5055  hypothetical protein  30.44 
 
 		 4255 aa  344  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3423  hypothetical protein  29.68 
 
 		 3341 aa  117  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.803787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2866  hypothetical protein  33.75 
 
 		 712 aa  56.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.621079  normal  0.921801 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  30.91 
 
 		 304 aa  53.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  26.77 
 
 		 1001 aa  53.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  24.04 
 
 		 307 aa  52.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  26.46 
 
 		 1021 aa  51.6  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11314  hypothetical protein  35.14 
 
 		 456 aa  51.2  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36.99 
 
 		 470 aa  50.1  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  28.12 
 
 		 446 aa  50.1  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  31.25 
 
 		 267 aa  48.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  30.59 
 
 		 142 aa  48.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.3 
 
 		 327 aa  47.8  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  29.29 
 
 		 430 aa  48.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  24.58 
 
 		 554 aa  47  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>