16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3423 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3423  hypothetical protein  100 
 
 		 3341 aa  6616    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.803787 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1993  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1187 aa  155  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0557  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1192 aa  152  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0650  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1192 aa  151  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1953  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1187 aa  149  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622767  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2924  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1171 aa  149  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2925  LysM domain-containing protein  25.29 
 
 		 3796 aa  144  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0917  LysM domain-containing protein  31.73 
 
 		 2847 aa  129  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1886  LysM domain-containing protein  31.73 
 
 		 2847 aa  129  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1952  LysM domain-containing protein  30.65 
 
 		 4131 aa  128  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0649  LysM domain-containing protein  30.65 
 
 		 4131 aa  128  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0556  LysM domain-containing protein  30.65 
 
 		 4121 aa  128  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1994  LysM domain-containing protein  30.32 
 
 		 4132 aa  127  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5055  hypothetical protein  24.56 
 
 		 4255 aa  122  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5059  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1072 aa  102  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2866  hypothetical protein  35.38 
 
 		 712 aa  72.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.621079  normal  0.921801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>