23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1994 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1952  LysM domain-containing protein  97.43 
 
 		 4131 aa  7908    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1886  LysM domain-containing protein  96.95 
 
 		 2847 aa  5392    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1994  LysM domain-containing protein  100 
 
 		 4132 aa  8284    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0556  LysM domain-containing protein  97.45 
 
 		 4121 aa  7905    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2925  LysM domain-containing protein  35.56 
 
 		 3796 aa  1088    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0649  LysM domain-containing protein  97.43 
 
 		 4131 aa  7958    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0917  LysM domain-containing protein  96.95 
 
 		 2847 aa  5392    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5055  hypothetical protein  31.3 
 
 		 4255 aa  345  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3423  hypothetical protein  29.35 
 
 		 3341 aa  116  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.803787 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  24.04 
 
 		 307 aa  55.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  28.23 
 
 		 446 aa  54.7  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2866  hypothetical protein  32.16 
 
 		 712 aa  54.3  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.621079  normal  0.921801 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  30.91 
 
 		 304 aa  54.3  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  29.34 
 
 		 1021 aa  52  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  31.76 
 
 		 142 aa  51.6  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11314  hypothetical protein  35.14 
 
 		 456 aa  50.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.14 
 
 		 1001 aa  51.2  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  33.73 
 
 		 173 aa  48.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  25.27 
 
 		 546 aa  47.8  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  35.62 
 
 		 470 aa  47.4  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.7 
 
 		 327 aa  47.4  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  30.21 
 
 		 267 aa  47  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 		 733 aa  47  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>