204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0524 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0524  ISBm1, transposase orfB, interruption-N  100 
 
 
124 aa  251  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0534  ISBm1, transposase orfB  98.33 
 
 
138 aa  123  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.162326  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0538  ISBm1, transposase orfB  98.33 
 
 
138 aa  123  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  90.62 
 
 
254 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  90.62 
 
 
254 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  90.62 
 
 
254 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  90.62 
 
 
254 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  90.62 
 
 
254 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  87.3 
 
 
254 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  87.3 
 
 
254 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  87.3 
 
 
254 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  87.3 
 
 
254 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  87.3 
 
 
254 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  87.3 
 
 
254 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  65.62 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  57.81 
 
 
142 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  57.81 
 
 
142 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  58.73 
 
 
210 aa  76.6  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  57.14 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  57.14 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  48.15 
 
 
176 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  48.15 
 
 
176 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  46.91 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  46.91 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  56.25 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  56.25 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  56.25 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  56.25 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  56.25 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  59.65 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  41.75 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  41.75 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  58.62 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  54.69 
 
 
260 aa  67.4  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  54.69 
 
 
260 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  54.69 
 
 
260 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  54.69 
 
 
260 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  42.11 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  35.71 
 
 
249 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0861  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0937  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119126  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  42.86 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  42.86 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  42.86 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  42.86 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  42.86 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  42.86 
 
 
260 aa  63.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  35.71 
 
 
249 aa  63.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1839  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 
206 aa  63.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.181674  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4122  hypothetical protein  42.86 
 
 
206 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  39.74 
 
 
249 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2056  hypothetical protein  39.19 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  33.65 
 
 
255 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 
186 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 
186 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  46.38 
 
 
273 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  49.21 
 
 
251 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  46.38 
 
 
260 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  46.38 
 
 
260 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  42.86 
 
 
252 aa  60.8  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2296  transposase  43.55 
 
 
142 aa  60.8  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  42.86 
 
 
252 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  42.86 
 
 
252 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  42.86 
 
 
252 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  42.86 
 
 
252 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  42.86 
 
 
252 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  42.86 
 
 
252 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  42.86 
 
 
252 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  42.86 
 
 
252 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  48.65 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4638  transposase IS4 family protein  44.64 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  53.12 
 
 
252 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  53.12 
 
 
252 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4650  transposase IS4 family protein  44.64 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3758  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0586009  normal  0.260182 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4034  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492844  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  40.62 
 
 
252 aa  57.4  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1761  hypothetical protein  50.88 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.997929 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4093  transposase IS4 family protein  41.07 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550334  normal  0.402512 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  39.47 
 
 
244 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0173  transposase, IS4 family protein  41.07 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0829  transposase, IS4 family protein  41.07 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2133  transposase, IS4 family protein  41.07 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3532  hypothetical protein  41.07 
 
 
129 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00922044  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3540  hypothetical protein  41.07 
 
 
129 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.718907 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3697  IS66 Orf2 family protein  41.07 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3823  hypothetical protein  41.07 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375839  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4288  hypothetical protein  41.07 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4294  hypothetical protein  41.07 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4300  hypothetical protein  41.07 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0174  IS4 family transposase  42.86 
 
 
129 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1006  transposase, IS4 family protein  41.07 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733901  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>