More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0514 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0514  transposase, interruption-C  100 
 
 
76 aa  153  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.414231  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  48 
 
 
95 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  49.3 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1323  ISCc1, transposase OrfB  47.95 
 
 
101 aa  68.6  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  49.3 
 
 
164 aa  67  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  48.65 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  50 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  46.67 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  50 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  46.67 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  47.89 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  47.89 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  47.89 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  47.89 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  47.89 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0535  IS5 family transposase orfB  47.89 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0531  IS5 family transposase orfB  47.22 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00392831  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0215  IS4 family transposase  45.21 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1290  IS4 family transposase  45.21 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.34094 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2924  IS4 family transposase  45.21 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0006  transposase, IS4  43.84 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345636  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  43.84 
 
 
176 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  43.84 
 
 
176 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0973  transposase, IS4  43.84 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.922887  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  43.84 
 
 
176 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1282  transposase, IS4  43.84 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.080194  normal  0.261741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1592  transposase, IS4  43.84 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  43.84 
 
 
176 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2473  transposase, IS4  43.84 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2498  transposase, IS4  43.84 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2824  transposase, IS4  43.84 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2861  transposase, IS4  43.84 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2923  transposase, IS4  43.84 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3013  transposase, IS4  43.84 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3037  transposase, IS4  43.84 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  43.84 
 
 
157 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  41.1 
 
 
253 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  41.1 
 
 
253 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  41.1 
 
 
253 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  41.1 
 
 
253 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2809  putative transposase  46.48 
 
 
121 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4349  putative transposase  46.48 
 
 
121 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1589  hypothetical protein  46.48 
 
 
121 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.419285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2661  putative transposase  46.48 
 
 
121 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225009  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0006  putative transposase  46.48 
 
 
121 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4215  transposase, IS4  44.59 
 
 
131 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0807  transposase  43.24 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1594  transposase  43.24 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2135  transposase  43.24 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3262  transposase  43.24 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5032  IS4 family transposase  43.24 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.137379  normal  0.729645 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5037  IS4 family transposase  43.24 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505561  normal  0.915342 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4093  transposase IS4 family protein  43.24 
 
 
129 aa  60.8  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550334  normal  0.402512 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1753  ISCc1, transposase OrfB  41.79 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303366  normal  0.533232 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4638  transposase IS4 family protein  41.33 
 
 
129 aa  60.1  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4650  transposase IS4 family protein  41.33 
 
 
129 aa  60.1  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3758  transposase IS4 family protein  42.67 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0586009  normal  0.260182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  48.65 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  42.47 
 
 
266 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  48.65 
 
 
252 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4034  transposase IS4 family protein  42.67 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7817  transposase  48.65 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267815  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  48.65 
 
 
252 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  39.73 
 
 
253 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09580  transposase IS4 family  46.48 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.899796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36160  transposase IS4 family  46.48 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  43.24 
 
 
186 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2121  hypothetical protein  52.54 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0548  hypothetical protein  38.36 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9114  transposase protein  38.36 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15010  transposase IS4 family  46.48 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10840  transposase IS4 family  46.48 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.658548  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23940  transposase IS4 family  46.48 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  43.24 
 
 
186 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33330  transposase IS4 family  46.48 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  43.24 
 
 
186 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49850  transposase IS4 family  46.48 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.102835  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0506  IS4 family transposase  42.67 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1528  IS4 family transposase  42.67 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2758  IS4 family transposase  42.67 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  43.66 
 
 
177 aa  58.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  43.66 
 
 
177 aa  58.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  43.66 
 
 
177 aa  58.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  43.66 
 
 
177 aa  58.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  43.66 
 
 
177 aa  58.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0593  transposase, IS4 family protein  42.42 
 
 
121 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1006  transposase, IS4 family protein  42.67 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733901  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  41.89 
 
 
336 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  41.89 
 
 
190 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  41.89 
 
 
190 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  41.89 
 
 
190 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  41.89 
 
 
190 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0168  transposase, IS4 family protein  41.89 
 
 
201 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  41.89 
 
 
190 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  41.89 
 
 
190 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  41.89 
 
 
190 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  47.92 
 
 
177 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  41.89 
 
 
190 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  41.89 
 
 
190 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  41.89 
 
 
190 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>