56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3357 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3357  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  291  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3902  hypothetical protein  86.81 
 
 		 146 aa  251  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7439  hypothetical protein  76.52 
 
 		 145 aa  213  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1732  hypothetical protein  68.94 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1022  hypothetical protein  70.15 
 
 		 144 aa  186  7e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0514  helix-turn-helix protein, CopG  59.09 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0319  hypothetical protein  62.7 
 
 		 127 aa  154  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0127184  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0811  helix-turn-helix protein, CopG  54.55 
 
 		 156 aa  151  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3189  hypothetical protein  55.3 
 
 		 173 aa  150  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3850  helix-turn-helix protein, CopG  49.63 
 
 		 142 aa  137  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00136711  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2617  hypothetical protein  52.11 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2326  CopG-like DNA-binding  45.52 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1195  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  130  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.423858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3540  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  130  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1494  CopG family protein  49.23 
 
 		 144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00276069  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3547  CopG-like DNA-binding  48.48 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.715677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7740  hypothetical protein  59.68 
 
 		 144 aa  127  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3005  CopG/DNA-binding domain-containing protein  41.3 
 
 		 145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.78909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3194  hypothetical protein  51.15 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.14235  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0590  hypothetical protein  56.91 
 
 		 142 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0750  hypothetical protein  55.65 
 
 		 144 aa  123  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.751711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3826  hypothetical protein  52.55 
 
 		 144 aa  123  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2877  hypothetical protein  55.65 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2700  CopG/DNA-binding domain-containing protein  44.36 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0802362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4194  CopG/DNA-binding domain-containing protein  43.28 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1505  hypothetical protein  52.03 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35730  hypothetical protein  43.61 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0700  hypothetical protein  53.23 
 
 		 145 aa  120  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0725  CopG/DNA-binding domain-containing protein  45.04 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.946674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30950  hypothetical protein  45.97 
 
 		 154 aa  119  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000217049  unclonable  2.16388e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1549  CopG-like DNA-binding  45.97 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0162848  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3707  CopG/DNA-binding domain-containing protein  45.6 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1680  helix-turn-helix protein, CopG  50 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1340  CopG-like DNA-binding  45.97 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2912  CopG/DNA-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0143  hypothetical protein  52.03 
 
 		 136 aa  118  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.802001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1894  CopG domain protein DNA-binding domain protein  44.8 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2644  CopG domain protein DNA-binding domain protein  45.6 
 
 		 154 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3690  hypothetical protein  45.04 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3507  CopG domain protein DNA-binding domain protein  42.86 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.709312  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0439  CopG/DNA-binding domain-containing protein  44.8 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2257  hypothetical protein  48.48 
 
 		 138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4006  hypothetical protein  55.38 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2819  hypothetical protein  48.48 
 
 		 143 aa  117  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2349  CopG/DNA-binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61469 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2003  CopG/DNA-binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 158 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1281  CopG/DNA-binding domain-containing protein  44.53 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3085  hypothetical protein  53.66 
 
 		 150 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.835522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0967  hypothetical protein  53.23 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2585  hypothetical protein  44.53 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2026  CopG/DNA-binding domain-containing protein  45.31 
 
 		 136 aa  97.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1834  CopG/DNA-binding domain-containing protein  38.52 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1066  putative regulator protein  35.29 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0687  hypothetical protein  32.03 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2345  hypothetical protein  32.52 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  29.46 
 
 		 461 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>