56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3085 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3085  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  299  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.835522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3826  hypothetical protein  85.29 
 
 		 144 aa  218  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0750  hypothetical protein  78.47 
 
 		 144 aa  212  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.751711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2877  hypothetical protein  78.17 
 
 		 143 aa  210  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7740  hypothetical protein  79.41 
 
 		 144 aa  199  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3540  hypothetical protein  68.15 
 
 		 149 aa  190  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1195  hypothetical protein  68.15 
 
 		 149 aa  190  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.423858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0590  hypothetical protein  78.2 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3194  hypothetical protein  70.92 
 
 		 149 aa  186  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.14235  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0700  hypothetical protein  73.91 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1505  hypothetical protein  74.05 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2819  hypothetical protein  72.14 
 
 		 143 aa  179  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3690  hypothetical protein  68.46 
 
 		 139 aa  176  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4006  hypothetical protein  74.26 
 
 		 144 aa  171  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0143  hypothetical protein  59.85 
 
 		 136 aa  157  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.802001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0967  hypothetical protein  64.71 
 
 		 143 aa  150  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1494  CopG family protein  53.79 
 
 		 144 aa  146  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00276069  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0811  helix-turn-helix protein, CopG  54.62 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0514  helix-turn-helix protein, CopG  50.77 
 
 		 140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3189  hypothetical protein  52.31 
 
 		 173 aa  134  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3902  hypothetical protein  55.28 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7439  hypothetical protein  53.66 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2326  CopG-like DNA-binding  44.85 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2617  hypothetical protein  53.44 
 
 		 150 aa  123  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3357  hypothetical protein  53.66 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1732  hypothetical protein  51.61 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3850  helix-turn-helix protein, CopG  43.26 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00136711  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3547  CopG-like DNA-binding  45.45 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.715677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3005  CopG/DNA-binding domain-containing protein  40.14 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.78909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2644  CopG domain protein DNA-binding domain protein  44.37 
 
 		 154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4194  CopG/DNA-binding domain-containing protein  42.97 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2700  CopG/DNA-binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0802362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1022  hypothetical protein  50 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2912  CopG/DNA-binding domain-containing protein  43.85 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1549  CopG-like DNA-binding  42.97 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0162848  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3507  CopG domain protein DNA-binding domain protein  43.08 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.709312  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1340  CopG-like DNA-binding  42.97 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30950  hypothetical protein  42.97 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000217049  unclonable  2.16388e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0439  CopG/DNA-binding domain-containing protein  42.97 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1680  helix-turn-helix protein, CopG  46.15 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3707  CopG/DNA-binding domain-containing protein  42.97 
 
 		 154 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1894  CopG domain protein DNA-binding domain protein  42.97 
 
 		 154 aa  106  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35730  hypothetical protein  42.97 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1281  CopG/DNA-binding domain-containing protein  42.97 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0725  CopG/DNA-binding domain-containing protein  42.97 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.946674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2349  CopG/DNA-binding domain-containing protein  41.35 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61469 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2003  CopG/DNA-binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 158 aa  103  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2257  hypothetical protein  43.2 
 
 		 138 aa  97.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0319  hypothetical protein  41.94 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0127184  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2585  hypothetical protein  43.07 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1066  putative regulator protein  33.07 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1834  CopG/DNA-binding domain-containing protein  35.88 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2026  CopG/DNA-binding domain-containing protein  38.13 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0687  hypothetical protein  28.89 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  32.67 
 
 		 461 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2345  hypothetical protein  23.39 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>