56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0967 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0967  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  277  4e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3826  hypothetical protein  68.53 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2819  hypothetical protein  68.18 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2877  hypothetical protein  70.68 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0750  hypothetical protein  71.21 
 
 		 144 aa  173  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.751711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3540  hypothetical protein  61.31 
 
 		 149 aa  172  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1195  hypothetical protein  61.31 
 
 		 149 aa  172  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.423858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7740  hypothetical protein  66.67 
 
 		 144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0700  hypothetical protein  64.75 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3085  hypothetical protein  64.71 
 
 		 150 aa  166  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.835522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0590  hypothetical protein  66.41 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3690  hypothetical protein  60.29 
 
 		 139 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3194  hypothetical protein  63.64 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.14235  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1505  hypothetical protein  62.6 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0143  hypothetical protein  61.07 
 
 		 136 aa  155  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.802001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0811  helix-turn-helix protein, CopG  56.39 
 
 		 156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0514  helix-turn-helix protein, CopG  56.59 
 
 		 140 aa  154  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4006  hypothetical protein  68.7 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1494  CopG family protein  55.64 
 
 		 144 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00276069  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3189  hypothetical protein  54.41 
 
 		 173 aa  145  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2326  CopG-like DNA-binding  53.38 
 
 		 145 aa  141  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3547  CopG-like DNA-binding  51.8 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.715677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3005  CopG/DNA-binding domain-containing protein  51.91 
 
 		 145 aa  134  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.78909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3902  hypothetical protein  51.13 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7439  hypothetical protein  50.77 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3850  helix-turn-helix protein, CopG  44.36 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00136711  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3357  hypothetical protein  53.23 
 
 		 145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2700  CopG/DNA-binding domain-containing protein  50.38 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0802362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30950  hypothetical protein  49.62 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000217049  unclonable  2.16388e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1549  CopG-like DNA-binding  49.62 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0162848  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1340  CopG-like DNA-binding  49.62 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1894  CopG domain protein DNA-binding domain protein  49.62 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2912  CopG/DNA-binding domain-containing protein  49.62 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3707  CopG/DNA-binding domain-containing protein  49.62 
 
 		 154 aa  123  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0439  CopG/DNA-binding domain-containing protein  49.62 
 
 		 154 aa  123  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3507  CopG domain protein DNA-binding domain protein  48.87 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.709312  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4194  CopG/DNA-binding domain-containing protein  46.62 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35730  hypothetical protein  48.09 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2349  CopG/DNA-binding domain-containing protein  47.37 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0725  CopG/DNA-binding domain-containing protein  48.85 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.946674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1281  CopG/DNA-binding domain-containing protein  48.85 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2617  hypothetical protein  49.29 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2003  CopG/DNA-binding domain-containing protein  48.09 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1732  hypothetical protein  49.59 
 
 		 141 aa  120  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2644  CopG domain protein DNA-binding domain protein  48.85 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1680  helix-turn-helix protein, CopG  53.85 
 
 		 149 aa  120  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1022  hypothetical protein  47.37 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2585  hypothetical protein  49.62 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0319  hypothetical protein  47.46 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0127184  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2257  hypothetical protein  42.06 
 
 		 138 aa  98.6  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1066  putative regulator protein  40.6 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1834  CopG/DNA-binding domain-containing protein  40 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2026  CopG/DNA-binding domain-containing protein  40.83 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0687  hypothetical protein  26.06 
 
 		 142 aa  67  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2345  hypothetical protein  23.19 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  29.67 
 
 		 461 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>