57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3826 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3826  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  287  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0750  hypothetical protein  91.97 
 
 		 144 aa  233  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.751711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2877  hypothetical protein  91.11 
 
 		 143 aa  229  7.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3085  hypothetical protein  85.29 
 
 		 150 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.835522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7740  hypothetical protein  79.17 
 
 		 144 aa  206  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1195  hypothetical protein  70.8 
 
 		 149 aa  200  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.423858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3540  hypothetical protein  70.8 
 
 		 149 aa  200  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2819  hypothetical protein  76.69 
 
 		 143 aa  192  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0700  hypothetical protein  72.34 
 
 		 145 aa  191  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3690  hypothetical protein  70.59 
 
 		 139 aa  189  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0590  hypothetical protein  74.26 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3194  hypothetical protein  68.09 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.14235  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4006  hypothetical protein  75.74 
 
 		 144 aa  179  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1505  hypothetical protein  70.23 
 
 		 142 aa  179  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0967  hypothetical protein  68.53 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0143  hypothetical protein  59.85 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.802001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0811  helix-turn-helix protein, CopG  52.63 
 
 		 156 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1494  CopG family protein  51.94 
 
 		 144 aa  143  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00276069  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0514  helix-turn-helix protein, CopG  50 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3902  hypothetical protein  53.62 
 
 		 146 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2326  CopG-like DNA-binding  48.87 
 
 		 145 aa  137  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7439  hypothetical protein  51.75 
 
 		 145 aa  136  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3189  hypothetical protein  51.15 
 
 		 173 aa  134  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3357  hypothetical protein  52.55 
 
 		 145 aa  134  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1732  hypothetical protein  52.76 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3547  CopG-like DNA-binding  46.67 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.715677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3005  CopG/DNA-binding domain-containing protein  42.65 
 
 		 145 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.78909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3850  helix-turn-helix protein, CopG  42.42 
 
 		 142 aa  124  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00136711  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2912  CopG/DNA-binding domain-containing protein  47.48 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2644  CopG domain protein DNA-binding domain protein  46.58 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4194  CopG/DNA-binding domain-containing protein  45.8 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2700  CopG/DNA-binding domain-containing protein  47.33 
 
 		 154 aa  120  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0802362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3507  CopG domain protein DNA-binding domain protein  46.04 
 
 		 154 aa  120  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.709312  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1340  CopG-like DNA-binding  46.56 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1549  CopG-like DNA-binding  46.56 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0162848  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0439  CopG/DNA-binding domain-containing protein  46.56 
 
 		 154 aa  118  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3707  CopG/DNA-binding domain-containing protein  46.56 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30950  hypothetical protein  45.8 
 
 		 154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000217049  unclonable  2.16388e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1894  CopG domain protein DNA-binding domain protein  45.8 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2617  hypothetical protein  50 
 
 		 150 aa  115  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35730  hypothetical protein  44.27 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1022  hypothetical protein  52.76 
 
 		 144 aa  114  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1281  CopG/DNA-binding domain-containing protein  45.04 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0725  CopG/DNA-binding domain-containing protein  45.04 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.946674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2003  CopG/DNA-binding domain-containing protein  44.27 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2349  CopG/DNA-binding domain-containing protein  44.27 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61469 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1680  helix-turn-helix protein, CopG  46.67 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522229  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2585  hypothetical protein  46.56 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2257  hypothetical protein  40.48 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0319  hypothetical protein  41.94 
 
 		 127 aa  92.8  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0127184  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1066  putative regulator protein  35.25 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1834  CopG/DNA-binding domain-containing protein  36.64 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2026  CopG/DNA-binding domain-containing protein  39.1 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0687  hypothetical protein  26.28 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  28.18 
 
 		 461 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1640  hypothetical protein  31.25 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2345  hypothetical protein  26.19 
 
 		 157 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>