51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2345 on replicon NC_011061
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011061  Paes_2345  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  319  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0687  hypothetical protein  51.77 
 
 		 142 aa  141  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1732  hypothetical protein  34.15 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3189  hypothetical protein  28.36 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0514  helix-turn-helix protein, CopG  25.55 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7439  hypothetical protein  30.89 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3357  hypothetical protein  32.52 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3902  hypothetical protein  32 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1022  hypothetical protein  34.15 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3850  helix-turn-helix protein, CopG  26.72 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00136711  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2026  CopG/DNA-binding domain-containing protein  34.19 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2257  hypothetical protein  31.19 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0811  helix-turn-helix protein, CopG  23.66 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0143  hypothetical protein  29.2 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.802001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2003  CopG/DNA-binding domain-containing protein  26.72 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0725  CopG/DNA-binding domain-containing protein  26.72 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.946674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1680  helix-turn-helix protein, CopG  26.72 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1834  CopG/DNA-binding domain-containing protein  29.91 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1281  CopG/DNA-binding domain-containing protein  25.86 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2349  CopG/DNA-binding domain-containing protein  26.72 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61469 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4194  CopG/DNA-binding domain-containing protein  26.72 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1494  CopG family protein  23.14 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00276069  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1549  CopG-like DNA-binding  26.72 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0162848  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1340  CopG-like DNA-binding  26.72 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35730  hypothetical protein  25.86 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2700  CopG/DNA-binding domain-containing protein  25.86 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0802362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0319  hypothetical protein  29.91 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0127184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30950  hypothetical protein  25.86 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000217049  unclonable  2.16388e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3707  CopG/DNA-binding domain-containing protein  25.86 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3005  CopG/DNA-binding domain-containing protein  24.64 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.78909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2644  CopG domain protein DNA-binding domain protein  25 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0700  hypothetical protein  24.14 
 
 		 145 aa  51.6  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2912  CopG/DNA-binding domain-containing protein  25 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3507  CopG domain protein DNA-binding domain protein  25 
 
 		 154 aa  51.2  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.709312  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3690  hypothetical protein  23.53 
 
 		 139 aa  50.8  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1894  CopG domain protein DNA-binding domain protein  25 
 
 		 154 aa  50.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0439  CopG/DNA-binding domain-containing protein  25 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2326  CopG-like DNA-binding  21.37 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1066  putative regulator protein  22.22 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1505  hypothetical protein  25.95 
 
 		 142 aa  47.4  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3194  hypothetical protein  23.4 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.14235  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0590  hypothetical protein  24.46 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2617  hypothetical protein  24.75 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2819  hypothetical protein  22.58 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3540  hypothetical protein  23.91 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1195  hypothetical protein  23.91 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.423858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7740  hypothetical protein  25.64 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2585  hypothetical protein  22.5 
 
 		 158 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3547  CopG-like DNA-binding  22.9 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.715677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4006  hypothetical protein  22.5 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0967  hypothetical protein  24.22 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>