56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0590 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0590  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  278  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1195  hypothetical protein  75.36 
 
 		 149 aa  213  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.423858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3540  hypothetical protein  75.36 
 
 		 149 aa  213  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4006  hypothetical protein  85.61 
 
 		 144 aa  204  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0700  hypothetical protein  77.94 
 
 		 145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3085  hypothetical protein  78.2 
 
 		 150 aa  190  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.835522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7740  hypothetical protein  76.52 
 
 		 144 aa  189  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0750  hypothetical protein  74.26 
 
 		 144 aa  189  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.751711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1505  hypothetical protein  74.42 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3826  hypothetical protein  74.26 
 
 		 144 aa  187  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2877  hypothetical protein  74.81 
 
 		 143 aa  183  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2819  hypothetical protein  75.76 
 
 		 143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3194  hypothetical protein  69.12 
 
 		 149 aa  179  9.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.14235  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3690  hypothetical protein  64.66 
 
 		 139 aa  169  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1494  CopG family protein  59.09 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00276069  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0143  hypothetical protein  60.15 
 
 		 136 aa  157  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.802001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0967  hypothetical protein  66.41 
 
 		 143 aa  150  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3902  hypothetical protein  55.38 
 
 		 146 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0514  helix-turn-helix protein, CopG  53.08 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7439  hypothetical protein  59.35 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0811  helix-turn-helix protein, CopG  53.08 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3357  hypothetical protein  56.91 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1732  hypothetical protein  56.56 
 
 		 141 aa  133  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3189  hypothetical protein  50.77 
 
 		 173 aa  130  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2326  CopG-like DNA-binding  48.48 
 
 		 145 aa  127  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1022  hypothetical protein  54.26 
 
 		 144 aa  123  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3850  helix-turn-helix protein, CopG  44.7 
 
 		 142 aa  123  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00136711  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2644  CopG domain protein DNA-binding domain protein  47.69 
 
 		 154 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2912  CopG/DNA-binding domain-containing protein  46.92 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2700  CopG/DNA-binding domain-containing protein  46.88 
 
 		 154 aa  117  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0802362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2617  hypothetical protein  55.65 
 
 		 150 aa  116  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1549  CopG-like DNA-binding  46.46 
 
 		 154 aa  116  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0162848  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1340  CopG-like DNA-binding  46.46 
 
 		 154 aa  116  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30950  hypothetical protein  46.46 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000217049  unclonable  2.16388e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3507  CopG domain protein DNA-binding domain protein  46.15 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.709312  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3547  CopG-like DNA-binding  47.69 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.715677 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1894  CopG domain protein DNA-binding domain protein  46.46 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0439  CopG/DNA-binding domain-containing protein  46.09 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3707  CopG/DNA-binding domain-containing protein  46.09 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3005  CopG/DNA-binding domain-containing protein  43.18 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.78909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35730  hypothetical protein  45.31 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4194  CopG/DNA-binding domain-containing protein  44.62 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1281  CopG/DNA-binding domain-containing protein  46.46 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0725  CopG/DNA-binding domain-containing protein  46.09 
 
 		 158 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.946674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2349  CopG/DNA-binding domain-containing protein  45.31 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61469 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2003  CopG/DNA-binding domain-containing protein  45.67 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1680  helix-turn-helix protein, CopG  44.44 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2257  hypothetical protein  43.08 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338715  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2585  hypothetical protein  48.03 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0319  hypothetical protein  44 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0127184  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1834  CopG/DNA-binding domain-containing protein  39.06 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2026  CopG/DNA-binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1066  putative regulator protein  31.62 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0687  hypothetical protein  29.01 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2345  hypothetical protein  24.46 
 
 		 157 aa  50.4  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  32.67 
 
 		 461 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>