56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2819 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2819  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  285  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1195  hypothetical protein  72.46 
 
 
149 aa  204  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.423858  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3540  hypothetical protein  72.46 
 
 
149 aa  204  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3826  hypothetical protein  75 
 
 
144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0750  hypothetical protein  73.68 
 
 
144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.751711  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0700  hypothetical protein  71.94 
 
 
145 aa  186  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7740  hypothetical protein  73.88 
 
 
144 aa  185  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2877  hypothetical protein  72.73 
 
 
143 aa  184  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3690  hypothetical protein  70.23 
 
 
139 aa  184  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0590  hypothetical protein  75.76 
 
 
142 aa  182  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3085  hypothetical protein  72.14 
 
 
150 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.835522  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1505  hypothetical protein  72.44 
 
 
142 aa  176  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3194  hypothetical protein  68.42 
 
 
149 aa  175  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.14235  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4006  hypothetical protein  75 
 
 
144 aa  166  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0967  hypothetical protein  68.18 
 
 
143 aa  161  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0143  hypothetical protein  61.07 
 
 
136 aa  155  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.802001  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1494  CopG family protein  60.16 
 
 
144 aa  154  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00276069  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0514  helix-turn-helix protein, CopG  52.71 
 
 
140 aa  141  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0811  helix-turn-helix protein, CopG  52.67 
 
 
156 aa  140  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3189  hypothetical protein  52.67 
 
 
173 aa  138  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3850  helix-turn-helix protein, CopG  46.92 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00136711  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2326  CopG-like DNA-binding  46.27 
 
 
145 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3005  CopG/DNA-binding domain-containing protein  42.45 
 
 
145 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.78909  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3357  hypothetical protein  48.48 
 
 
145 aa  124  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800437  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1732  hypothetical protein  46.67 
 
 
141 aa  123  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3902  hypothetical protein  48.85 
 
 
146 aa  123  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7439  hypothetical protein  48.09 
 
 
145 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2617  hypothetical protein  48.25 
 
 
150 aa  120  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2644  CopG domain protein DNA-binding domain protein  47.45 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30950  hypothetical protein  47.69 
 
 
154 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000217049  unclonable  2.16388e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1894  CopG domain protein DNA-binding domain protein  47.69 
 
 
154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2700  CopG/DNA-binding domain-containing protein  47.69 
 
 
154 aa  117  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0802362  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2912  CopG/DNA-binding domain-containing protein  48.46 
 
 
148 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3507  CopG domain protein DNA-binding domain protein  47.69 
 
 
154 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.709312  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3707  CopG/DNA-binding domain-containing protein  46.92 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1549  CopG-like DNA-binding  47.29 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0162848  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1340  CopG-like DNA-binding  47.29 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126057  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4194  CopG/DNA-binding domain-containing protein  43.94 
 
 
150 aa  114  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0439  CopG/DNA-binding domain-containing protein  46.92 
 
 
154 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1281  CopG/DNA-binding domain-containing protein  47.69 
 
 
154 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35730  hypothetical protein  46.92 
 
 
154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0725  CopG/DNA-binding domain-containing protein  47.69 
 
 
158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.946674  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2003  CopG/DNA-binding domain-containing protein  46.92 
 
 
158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2349  CopG/DNA-binding domain-containing protein  46.92 
 
 
158 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.61469 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1022  hypothetical protein  46.67 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3547  CopG-like DNA-binding  43.51 
 
 
154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.715677 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1680  helix-turn-helix protein, CopG  46.51 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522229  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2585  hypothetical protein  49.61 
 
 
158 aa  99.4  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0319  hypothetical protein  43.55 
 
 
127 aa  94  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0127184  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2257  hypothetical protein  41.27 
 
 
138 aa  94  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338715  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0687  hypothetical protein  31.11 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1066  putative regulator protein  33.33 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638052  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2026  CopG/DNA-binding domain-containing protein  37.23 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1834  CopG/DNA-binding domain-containing protein  35.83 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2345  hypothetical protein  22.58 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  32.14 
 
 
461 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>