57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1894 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1894  CopG domain protein DNA-binding domain protein  100 
 
 		 154 aa  306  5e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3707  CopG/DNA-binding domain-containing protein  94.77 
 
 		 154 aa  292  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2700  CopG/DNA-binding domain-containing protein  92.86 
 
 		 154 aa  289  9e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0802362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1340  CopG-like DNA-binding  92.86 
 
 		 154 aa  289  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1549  CopG-like DNA-binding  92.86 
 
 		 154 aa  289  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0162848  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3507  CopG domain protein DNA-binding domain protein  90.91 
 
 		 154 aa  283  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.709312  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0439  CopG/DNA-binding domain-containing protein  95.45 
 
 		 154 aa  282  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30950  hypothetical protein  96.48 
 
 		 154 aa  280  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000217049  unclonable  2.16388e-22 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2003  CopG/DNA-binding domain-containing protein  88.31 
 
 		 158 aa  276  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1281  CopG/DNA-binding domain-containing protein  88.31 
 
 		 154 aa  276  7e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0725  CopG/DNA-binding domain-containing protein  88.31 
 
 		 158 aa  275  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.946674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2349  CopG/DNA-binding domain-containing protein  88.96 
 
 		 158 aa  274  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61469 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2644  CopG domain protein DNA-binding domain protein  87.58 
 
 		 154 aa  270  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35730  hypothetical protein  90.85 
 
 		 154 aa  269  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2912  CopG/DNA-binding domain-containing protein  90.21 
 
 		 148 aa  267  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4194  CopG/DNA-binding domain-containing protein  80.56 
 
 		 150 aa  242  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2585  hypothetical protein  85.44 
 
 		 158 aa  236  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0811  helix-turn-helix protein, CopG  48.87 
 
 		 156 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0514  helix-turn-helix protein, CopG  49.61 
 
 		 140 aa  140  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3189  hypothetical protein  51.16 
 
 		 173 aa  135  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3902  hypothetical protein  46.03 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3357  hypothetical protein  45.16 
 
 		 145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1494  CopG family protein  44.96 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00276069  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3005  CopG/DNA-binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.78909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2326  CopG-like DNA-binding  40.3 
 
 		 145 aa  117  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7439  hypothetical protein  46.03 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3690  hypothetical protein  44.53 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3547  CopG-like DNA-binding  40.6 
 
 		 154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.715677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7740  hypothetical protein  44.36 
 
 		 144 aa  110  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2026  CopG/DNA-binding domain-containing protein  49.58 
 
 		 136 aa  110  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0700  hypothetical protein  45.38 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3850  helix-turn-helix protein, CopG  39.23 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00136711  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1732  hypothetical protein  48.62 
 
 		 141 aa  107  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2819  hypothetical protein  47.69 
 
 		 143 aa  107  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0590  hypothetical protein  46.46 
 
 		 142 aa  106  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0967  hypothetical protein  49.62 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1195  hypothetical protein  40.91 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.423858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1680  helix-turn-helix protein, CopG  48 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3540  hypothetical protein  40.91 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3826  hypothetical protein  45.8 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3194  hypothetical protein  44.96 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.14235  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0750  hypothetical protein  44.19 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.751711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2877  hypothetical protein  47.46 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0143  hypothetical protein  44.53 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.802001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1834  CopG/DNA-binding domain-containing protein  45.38 
 
 		 139 aa  99.4  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3085  hypothetical protein  42.97 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.835522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1022  hypothetical protein  45.69 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1505  hypothetical protein  41.46 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4006  hypothetical protein  46.46 
 
 		 144 aa  93.6  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2257  hypothetical protein  42.75 
 
 		 138 aa  88.2  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2617  hypothetical protein  43.14 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0319  hypothetical protein  37.01 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0127184  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1066  putative regulator protein  32.56 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  33.33 
 
 		 461 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0687  hypothetical protein  23.31 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2345  hypothetical protein  25 
 
 		 157 aa  50.4  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1640  hypothetical protein  25.71 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>