56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0439 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0439  CopG/DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 154 aa  308  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1340  CopG-like DNA-binding  96.75 
 
 		 154 aa  301  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1549  CopG-like DNA-binding  96.75 
 
 		 154 aa  301  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0162848  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2700  CopG/DNA-binding domain-containing protein  96.75 
 
 		 154 aa  300  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0802362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3707  CopG/DNA-binding domain-containing protein  97.39 
 
 		 154 aa  300  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3507  CopG domain protein DNA-binding domain protein  93.51 
 
 		 154 aa  289  9e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.709312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30950  hypothetical protein  97.18 
 
 		 154 aa  284  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000217049  unclonable  2.16388e-22 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2003  CopG/DNA-binding domain-containing protein  90.26 
 
 		 158 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0725  CopG/DNA-binding domain-containing protein  90.26 
 
 		 158 aa  280  6.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.946674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1894  CopG domain protein DNA-binding domain protein  95.77 
 
 		 154 aa  278  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1281  CopG/DNA-binding domain-containing protein  89.61 
 
 		 154 aa  278  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2349  CopG/DNA-binding domain-containing protein  89.61 
 
 		 158 aa  275  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61469 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2644  CopG domain protein DNA-binding domain protein  89.54 
 
 		 154 aa  274  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2912  CopG/DNA-binding domain-containing protein  88.31 
 
 		 148 aa  270  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35730  hypothetical protein  91.55 
 
 		 154 aa  270  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4194  CopG/DNA-binding domain-containing protein  81.94 
 
 		 150 aa  244  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2585  hypothetical protein  87.34 
 
 		 158 aa  240  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0811  helix-turn-helix protein, CopG  48.87 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0514  helix-turn-helix protein, CopG  49.61 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3189  hypothetical protein  51.16 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3902  hypothetical protein  46.03 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2326  CopG-like DNA-binding  42.75 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3005  CopG/DNA-binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.78909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3357  hypothetical protein  44.8 
 
 		 145 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1494  CopG family protein  44.96 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00276069  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7439  hypothetical protein  46.03 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3690  hypothetical protein  44.53 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3547  CopG-like DNA-binding  42.75 
 
 		 154 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.715677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7740  hypothetical protein  44.36 
 
 		 144 aa  110  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0700  hypothetical protein  45.38 
 
 		 145 aa  110  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2026  CopG/DNA-binding domain-containing protein  49.58 
 
 		 136 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3194  hypothetical protein  46.51 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.14235  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3540  hypothetical protein  40.91 
 
 		 149 aa  107  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1195  hypothetical protein  40.91 
 
 		 149 aa  107  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.423858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3826  hypothetical protein  46.56 
 
 		 144 aa  107  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1732  hypothetical protein  48.62 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3850  helix-turn-helix protein, CopG  39.23 
 
 		 142 aa  106  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00136711  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0590  hypothetical protein  46.09 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1680  helix-turn-helix protein, CopG  48 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0967  hypothetical protein  49.62 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0750  hypothetical protein  44.96 
 
 		 144 aa  104  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.751711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2819  hypothetical protein  46.92 
 
 		 143 aa  103  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2877  hypothetical protein  48.31 
 
 		 143 aa  103  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0143  hypothetical protein  44.53 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.802001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3085  hypothetical protein  42.97 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.835522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1022  hypothetical protein  45.69 
 
 		 144 aa  98.2  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1834  CopG/DNA-binding domain-containing protein  45.38 
 
 		 139 aa  97.4  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1505  hypothetical protein  41.32 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4006  hypothetical protein  46.46 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2257  hypothetical protein  43.51 
 
 		 138 aa  90.9  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2617  hypothetical protein  34.69 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0319  hypothetical protein  38.66 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0127184  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1066  putative regulator protein  34.11 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  35.92 
 
 		 461 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0687  hypothetical protein  25.6 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2345  hypothetical protein  25 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>