89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2732 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2732  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  237  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2291  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  65 
 
 		 104 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29935  normal  0.0503314 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1934  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.43 
 
 		 106 aa  133  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6066  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  63 
 
 		 104 aa  133  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0493901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1795  hypothetical protein  62.24 
 
 		 106 aa  130  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1314  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.6 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2745  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.57 
 
 		 112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1433  antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.43 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798713  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2403  antibiotic biosynthesis monooxygenase  57 
 
 		 100 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.661778 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6540  antibiotic biosynthesis monooxygenase  60 
 
 		 104 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.463782  normal  0.525958 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0563  hypothetical protein  54.9 
 
 		 104 aa  121  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2416  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.04 
 
 		 110 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3126  antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.58 
 
 		 115 aa  121  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.312159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3624  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.9 
 
 		 104 aa  121  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2325  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.91 
 
 		 111 aa  120  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0149845  normal  0.743995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1042  antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.6 
 
 		 111 aa  120  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3012  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.43 
 
 		 104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1974  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.45 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1169  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.59 
 
 		 111 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2355  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.81 
 
 		 138 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0493653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0972  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.57 
 
 		 111 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0161  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.17 
 
 		 111 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4190  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.94 
 
 		 111 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269641  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2484  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.53 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.693469  normal  0.221304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0826  hypothetical protein  52.53 
 
 		 104 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.5 
 
 		 104 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2308  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.06 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2457  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.55 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.608151  normal  0.197071 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1473  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.49 
 
 		 101 aa  111  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3263  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.45 
 
 		 104 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.310801 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00050  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  51.49 
 
 		 101 aa  110  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2161  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.54 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2137  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.96 
 
 		 104 aa  103  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149356  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4034  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.312293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1600  monooxygenase  45.45 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.299485  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3445  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.37 
 
 		 108 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2922  decreased coverage  0.000158431 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1632  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0472  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.57 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2368  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.38 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.350476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4367  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.64 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32820  predicted protein  30.47 
 
 		 274 aa  65.1  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0884  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.74 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2444  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.34 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000094626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2196  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.31 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0294668  normal  0.4212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3570  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.66 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3305  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.68 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.934506  hitchhiker  0.000279112 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2488  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.69 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42523  predicted protein  36.26 
 
 		 323 aa  54.3  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2662  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  34.62 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2288  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.62 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000787816 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0619  hypothetical protein  32.38 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0668508  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1380  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.44 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2170  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00297448  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3455  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100306  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1165  hypothetical protein  31.73 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1228  hypothetical protein  31.73 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4204  hypothetical protein  31.73 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1150  hypothetical protein  31.73 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1101  hypothetical protein  31.73 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0997  hypothetical protein  34.21 
 
 		 167 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0982  hypothetical protein  34.21 
 
 		 167 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1068  hypothetical protein  34.21 
 
 		 167 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0987  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0162  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.88 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000571541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3524  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187427  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0984  hypothetical protein  32.89 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0822  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.89 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13625  hypothetical protein  30.77 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57059e-29  hitchhiker  0.00966877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3958  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.55 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0156  heme-degrading monooxygenase IsdI  28.75 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0151  heme-degrading monooxygenase IsdI  28.75 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0912  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.11 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563989  normal  0.186238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4751  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.3 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0111986  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4837  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.3 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5137  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.3 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.72056  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0586  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.68 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2807  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.75 
 
 		 114 aa  41.2  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3811  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.97 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00303345  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1347  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.7 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516596  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2173  hypothetical protein  27.71 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1233  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.06 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5352  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.62 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4656  heme-degrading monooxygenase IsdG  31.03 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4782  heme-degrading monooxygenase IsdG  31.03 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4287  heme-degrading monooxygenase IsdG  31.03 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00056068  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4437  heme-degrading monooxygenase IsdG  31.03 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000517325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4669  heme-degrading monooxygenase IsdG  31.03 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4666  heme-degrading monooxygenase IsdG  31.03 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>