64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2403 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2403  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
100 aa  201  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.661778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2308  antibiotic biosynthesis monooxygenase  68.37 
 
 
102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1795  hypothetical protein  61.86 
 
 
106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1473  antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.39 
 
 
101 aa  126  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2732  hypothetical protein  57 
 
 
113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00050  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  61.39 
 
 
101 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6066  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  54 
 
 
104 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0493901 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3624  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.9 
 
 
104 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0563  hypothetical protein  55.88 
 
 
104 aa  120  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1433  antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.45 
 
 
104 aa  120  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798713  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2291  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  53 
 
 
104 aa  120  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29935  normal  0.0503314 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6540  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56 
 
 
104 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.463782  normal  0.525958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3012  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.47 
 
 
104 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2745  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.57 
 
 
112 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4190  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.94 
 
 
111 aa  117  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269641  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2325  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.46 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0149845  normal  0.743995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3263  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.48 
 
 
104 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.310801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2416  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.47 
 
 
110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3126  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.54 
 
 
115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.312159  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1934  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.55 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1974  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.96 
 
 
112 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129762  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2161  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.56 
 
 
109 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.5 
 
 
104 aa  110  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309301  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2484  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.51 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.693469  normal  0.221304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0826  hypothetical protein  50.51 
 
 
104 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2457  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.54 
 
 
110 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.608151  normal  0.197071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0161  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.47 
 
 
111 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1042  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.52 
 
 
111 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0514352 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1314  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.51 
 
 
107 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2355  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.48 
 
 
138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0493653  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0972  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.52 
 
 
111 aa  107  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4034  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 
100 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.312293  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1169  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.51 
 
 
111 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1600  monooxygenase  45.45 
 
 
103 aa  101  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.299485  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2137  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43 
 
 
104 aa  93.2  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149356  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0472  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43 
 
 
102 aa  83.2  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1632  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3445  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.32 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2922  decreased coverage  0.000158431 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2368  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.4 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.350476  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3455  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.57 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100306  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32820  predicted protein  36.54 
 
 
274 aa  64.7  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2196  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.64 
 
 
162 aa  60.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0294668  normal  0.4212 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.27 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100568  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2170  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.34 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00297448  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3305  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.98 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.934506  hitchhiker  0.000279112 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42523  predicted protein  30.4 
 
 
323 aa  55.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2488  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
102 aa  53.9  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2444  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000094626  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4367  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.01 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2288  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.62 
 
 
104 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787816 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2662  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  34.62 
 
 
104 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3570  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.01 
 
 
119 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1380  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0884  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5360  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.81 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000102648  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4876  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.81 
 
 
122 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000210055  hitchhiker  0.00000000162299 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4359  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.81 
 
 
122 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189574  unclonable  0.00000450981 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2632  hypothetical protein  25 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2686  hypothetical protein  25 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4551  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
99 aa  40.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0619  hypothetical protein  28.75 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0668508  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0151  heme-degrading monooxygenase IsdI  27.5 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0156  heme-degrading monooxygenase IsdI  27.5 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17660  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  41.18 
 
 
127 aa  40  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188096  normal  0.806629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>