87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1473 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1473  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
101 aa  210  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00050  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  70.3 
 
 
101 aa  150  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2308  antibiotic biosynthesis monooxygenase  64 
 
 
102 aa  135  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2403  antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.39 
 
 
100 aa  126  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.661778 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0563  hypothetical protein  56.31 
 
 
104 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3624  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.31 
 
 
104 aa  116  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2484  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54 
 
 
104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.693469  normal  0.221304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1795  hypothetical protein  55.1 
 
 
106 aa  114  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0826  hypothetical protein  53 
 
 
104 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2732  hypothetical protein  51.49 
 
 
113 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6540  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51 
 
 
104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.463782  normal  0.525958 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2745  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4190  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 
111 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269641  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1600  monooxygenase  50 
 
 
103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.299485  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1433  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.96 
 
 
104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798713  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3263  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.94 
 
 
104 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.310801 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3012  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.96 
 
 
104 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2291  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  48 
 
 
104 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29935  normal  0.0503314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6066  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47 
 
 
104 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0493901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4034  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.48 
 
 
100 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.312293  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2416  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.52 
 
 
110 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3126  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49 
 
 
115 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.312159  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0161  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.54 
 
 
111 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2355  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.54 
 
 
138 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0493653  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1934  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  48 
 
 
106 aa  99.8  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.06 
 
 
104 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309301  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2325  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.53 
 
 
111 aa  98.6  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0149845  normal  0.743995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2457  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.5 
 
 
110 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.608151  normal  0.197071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1974  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.12 
 
 
112 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129762  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1042  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.51 
 
 
111 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0514352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0972  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.06 
 
 
111 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2161  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.5 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1169  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.06 
 
 
111 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0472  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.98 
 
 
102 aa  93.6  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1314  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.55 
 
 
107 aa  92  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2137  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.58 
 
 
104 aa  82  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149356  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1632  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.64 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3445  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.24 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2922  decreased coverage  0.000158431 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2196  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.63 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0294668  normal  0.4212 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32820  predicted protein  36.89 
 
 
274 aa  68.2  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2444  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.34 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000094626  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2368  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.350476  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0884  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34 
 
 
112 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.66 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100568  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4367  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.65 
 
 
119 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3455  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.74 
 
 
101 aa  60.1  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100306  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2170  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.3 
 
 
112 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00297448  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3305  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.7 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.934506  hitchhiker  0.000279112 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1380  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.7 
 
 
102 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3570  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.68 
 
 
119 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42523  predicted protein  31.2 
 
 
323 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0671  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.62 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2173  hypothetical protein  32.5 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2686  hypothetical protein  32.53 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2632  hypothetical protein  32.53 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0162  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.62 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000571541  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2488  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.3 
 
 
102 aa  47  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1101  hypothetical protein  28.41 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1228  hypothetical protein  28.41 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1150  hypothetical protein  28.41 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1068  hypothetical protein  28.41 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0982  hypothetical protein  28.41 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0997  hypothetical protein  28.41 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0822  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.42 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4204  hypothetical protein  28.21 
 
 
165 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0987  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.21 
 
 
169 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0156  heme-degrading monooxygenase IsdI  33.33 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0151  heme-degrading monooxygenase IsdI  33.33 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0984  hypothetical protein  27.27 
 
 
167 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0647  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
166 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1165  hypothetical protein  27.27 
 
 
165 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0619  hypothetical protein  35.71 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0668508  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5360  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000102648  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0764  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00475722  hitchhiker  0.0000687435 
 
 
 
NC_009565  TBFG_13625  hypothetical protein  31 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57059e-29  hitchhiker  0.00966877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4927  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 
122 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111834  normal  0.0525996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3440  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 
122 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000008426  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1195  heme-degrading monooxygenase IsdG  30.34 
 
 
107 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.541524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1217  heme-degrading monooxygenase IsdG  30.34 
 
 
107 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3958  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.38 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3524  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187427  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0586  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.51 
 
 
108 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35390  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  31.63 
 
 
99 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2288  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.95 
 
 
104 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787816 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2662  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  28.95 
 
 
104 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1233  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2807  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
114 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>