63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0161 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0161  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 111 aa  228  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2355  antibiotic biosynthesis monooxygenase  92.79 
 
 		 138 aa  218  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0493653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2416  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  83.64 
 
 		 110 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1974  antibiotic biosynthesis monooxygenase  77.68 
 
 		 112 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2325  antibiotic biosynthesis monooxygenase  74.77 
 
 		 111 aa  181  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0149845  normal  0.743995 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6540  antibiotic biosynthesis monooxygenase  64.08 
 
 		 104 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.463782  normal  0.525958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3126  antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.09 
 
 		 115 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.312159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6066  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.05 
 
 		 104 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0493901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1795  hypothetical protein  62.14 
 
 		 106 aa  136  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0972  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.22 
 
 		 111 aa  136  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1042  antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.22 
 
 		 111 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1169  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.25 
 
 		 111 aa  134  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2291  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.14 
 
 		 104 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29935  normal  0.0503314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2457  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.76 
 
 		 110 aa  131  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.608151  normal  0.197071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2161  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.45 
 
 		 109 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1934  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  62.38 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1314  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.05 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2745  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.87 
 
 		 112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2732  hypothetical protein  52.17 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4190  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.5 
 
 		 111 aa  113  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269641  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1433  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.37 
 
 		 104 aa  113  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798713  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00050  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  53.47 
 
 		 101 aa  110  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3624  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.46 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3445  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.38 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2922  decreased coverage  0.000158431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2403  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.47 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.661778 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0563  hypothetical protein  52 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.49 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3012  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.51 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3263  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.51 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.310801 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1600  monooxygenase  48.04 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.299485  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2137  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.51 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149356  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1473  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.54 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2484  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.6 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.693469  normal  0.221304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0826  hypothetical protein  46.6 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4034  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.5 
 
 		 100 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.312293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2308  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.45 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0472  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.79 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1632  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.64 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32820  predicted protein  41.51 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2170  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.66 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00297448  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2444  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.65 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000094626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42523  predicted protein  34.07 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3305  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.934506  hitchhiker  0.000279112 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.67 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2196  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.59 
 
 		 162 aa  53.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0294668  normal  0.4212 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2288  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.16 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000787816 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2662  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  38.16 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2368  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.68 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.350476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0884  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 		 112 aa  50.4  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3455  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 		 101 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100306  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1380  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2173  hypothetical protein  29.76 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4367  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3570  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0162  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.17 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000571541  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2488  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1233  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17660  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  39.22 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188096  normal  0.806629 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0619  hypothetical protein  31.71 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0668508  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2632  hypothetical protein  25 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2686  hypothetical protein  25 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3524  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6639  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.56 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>