71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6540 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6540  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
104 aa  216  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.463782  normal  0.525958 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6066  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  81.73 
 
 
104 aa  186  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0493901 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2291  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  80.77 
 
 
104 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29935  normal  0.0503314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1795  hypothetical protein  71.84 
 
 
106 aa  159  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2325  antibiotic biosynthesis monooxygenase  65.05 
 
 
111 aa  149  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0149845  normal  0.743995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1974  antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.46 
 
 
112 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129762  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1314  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  64.42 
 
 
107 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2416  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  60 
 
 
110 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0161  antibiotic biosynthesis monooxygenase  64.08 
 
 
111 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2355  antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.17 
 
 
138 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0493653  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3126  antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.11 
 
 
115 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.312159  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0972  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.46 
 
 
111 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1042  antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.11 
 
 
111 aa  136  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0514352 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2745  antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.22 
 
 
112 aa  136  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1169  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.46 
 
 
111 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2161  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  60.19 
 
 
109 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2457  antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.17 
 
 
110 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.608151  normal  0.197071 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4190  antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.62 
 
 
111 aa  130  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269641  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3012  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  60.95 
 
 
104 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1433  antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.28 
 
 
104 aa  124  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798713  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2732  hypothetical protein  60 
 
 
113 aa  124  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0563  hypothetical protein  59.8 
 
 
104 aa  123  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3263  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.1 
 
 
104 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.310801 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3624  antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.84 
 
 
104 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2484  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.85 
 
 
104 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.693469  normal  0.221304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0826  hypothetical protein  53.85 
 
 
104 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2403  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56 
 
 
100 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.661778 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1934  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.45 
 
 
106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1600  monooxygenase  53.4 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.299485  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00050  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  55 
 
 
101 aa  114  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.4 
 
 
104 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309301  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2137  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.85 
 
 
104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149356  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2308  antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.1 
 
 
102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3445  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2922  decreased coverage  0.000158431 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1473  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51 
 
 
101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4034  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52 
 
 
100 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.312293  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0472  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.69 
 
 
102 aa  87.4  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1632  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37 
 
 
100 aa  77  0.00000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32820  predicted protein  40 
 
 
274 aa  75.1  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3455  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.2 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100306  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.77 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100568  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2368  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.350476  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2444  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000094626  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2170  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 
112 aa  57.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00297448  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1380  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.04 
 
 
102 aa  57.4  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2196  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
162 aa  57  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0294668  normal  0.4212 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0884  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.01 
 
 
112 aa  52.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3305  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 
120 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.934506  hitchhiker  0.000279112 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42523  predicted protein  32.63 
 
 
323 aa  51.6  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1233  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.26 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2288  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787816 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2662  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  38.46 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0619  hypothetical protein  30.84 
 
 
112 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0668508  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4367  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.04 
 
 
119 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2488  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.53 
 
 
102 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2173  hypothetical protein  32.5 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3570  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.66 
 
 
119 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2632  hypothetical protein  30 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2686  hypothetical protein  30 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3524  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187427  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0151  heme-degrading monooxygenase IsdI  30 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0156  heme-degrading monooxygenase IsdI  30 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1068  hypothetical protein  27.96 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0984  hypothetical protein  27.96 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0982  hypothetical protein  27.96 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0997  hypothetical protein  27.96 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13625  hypothetical protein  30.69 
 
 
105 aa  40.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57059e-29  hitchhiker  0.00966877 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1101  hypothetical protein  24.18 
 
 
165 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1228  hypothetical protein  24.18 
 
 
165 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4204  hypothetical protein  24.18 
 
 
165 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1150  hypothetical protein  24.18 
 
 
165 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>