77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2173 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2173  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  305  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2686  hypothetical protein  63.01 
 
 
159 aa  201  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2632  hypothetical protein  63.01 
 
 
159 aa  201  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0822  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.27 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1101  hypothetical protein  36.46 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0647  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.56 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1165  hypothetical protein  35.79 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4204  hypothetical protein  35.42 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1068  hypothetical protein  35.79 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0997  hypothetical protein  35.79 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0984  hypothetical protein  35.79 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0982  hypothetical protein  35.79 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1150  hypothetical protein  35.79 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1228  hypothetical protein  35.79 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0987  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.48 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2488  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.67 
 
 
102 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2196  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0294668  normal  0.4212 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0884  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.62 
 
 
112 aa  60.5  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4367  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
119 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.84 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100568  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0912  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563989  normal  0.186238 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2444  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000094626  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3524  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.06 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187427  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3305  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
120 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.934506  hitchhiker  0.000279112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3958  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1795  hypothetical protein  34.94 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0619  hypothetical protein  31.46 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0668508  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3570  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
119 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3811  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.86 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00303345  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1433  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798713  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1600  monooxygenase  33.33 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.299485  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1473  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.5 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13625  hypothetical protein  32.35 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57059e-29  hitchhiker  0.00966877 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00050  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  32.1 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0205  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.71 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.776817  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0161  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.76 
 
 
111 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0826  hypothetical protein  33.75 
 
 
104 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8033  hypothetical protein  31.17 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0870707  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3455  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.95 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100306  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6540  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.5 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.463782  normal  0.525958 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2484  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.5 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.693469  normal  0.221304 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1934  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2368  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.350476  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2355  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.41 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0493653  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30250  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  31.15 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1347  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.73 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516596  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32820  predicted protein  29.03 
 
 
274 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2416  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2325  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.76 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0149845  normal  0.743995 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09590  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  25.61 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32308  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0586  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.11 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3540  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.67 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0441124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2807  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.4 
 
 
114 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4190  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.86 
 
 
111 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269641  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3012  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 
104 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42523  predicted protein  23.81 
 
 
323 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2170  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.75 
 
 
112 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00297448  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2137  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.4 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149356  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2291  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.75 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29935  normal  0.0503314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6066  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.75 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0493901 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2745  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.06 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2662  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  28.38 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1974  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.75 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129762  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2288  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.38 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5352  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.08 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0472  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4034  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.24 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.312293  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0339  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.03 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1380  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.33 
 
 
102 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0563  hypothetical protein  29.41 
 
 
104 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0960  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.79 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.710759  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2308  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.95 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274785 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4837  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.3 
 
 
109 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4751  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.3 
 
 
109 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0111986  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5137  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.3 
 
 
109 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.72056  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2732  hypothetical protein  27.71 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10750  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 
109 aa  41.2  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.857641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>