66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30250 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_30250  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
94 aa  190  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09590  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  60 
 
 
101 aa  116  9e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32308  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0960  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.74 
 
 
102 aa  101  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.710759  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0339  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.79 
 
 
103 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35390  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  54.35 
 
 
99 aa  98.6  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0205  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.54 
 
 
119 aa  97.8  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.776817  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13625  hypothetical protein  52.58 
 
 
105 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57059e-29  hitchhiker  0.00966877 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5137  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.69 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.72056  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4837  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.69 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4751  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.69 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0111986  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5352  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.61 
 
 
117 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0586  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.49 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10750  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  50 
 
 
109 aa  90.1  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.857641 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1347  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.54 
 
 
99 aa  89.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516596  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3540  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.09 
 
 
120 aa  80.1  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0441124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2807  antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.09 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3524  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.46 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187427  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3958  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.03 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0274  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.3 
 
 
98 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3811  antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.09 
 
 
124 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00303345  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8033  hypothetical protein  57.58 
 
 
124 aa  77  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0870707  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0619  hypothetical protein  55.38 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0668508  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0912  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.06 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563989  normal  0.186238 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0234  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.13 
 
 
98 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.392876 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2488  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.4 
 
 
102 aa  68.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17660  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  53.42 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188096  normal  0.806629 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3377  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000506782  hitchhiker  0.000558279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6639  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.28 
 
 
108 aa  57.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2662  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  42.42 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2288  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.42 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787816 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.27 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100568  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2686  hypothetical protein  29.23 
 
 
159 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2632  hypothetical protein  29.23 
 
 
159 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3455  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.06 
 
 
101 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100306  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1380  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.91 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1974  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
112 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129762  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0987  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 
169 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1150  hypothetical protein  29.41 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4204  hypothetical protein  29.41 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1165  hypothetical protein  29.41 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1101  hypothetical protein  29.41 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1228  hypothetical protein  29.41 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0822  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 
157 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0997  hypothetical protein  29.41 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0982  hypothetical protein  29.41 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0984  hypothetical protein  29.41 
 
 
167 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1068  hypothetical protein  29.41 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2173  hypothetical protein  31.15 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4367  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3305  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.94 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.934506  hitchhiker  0.000279112 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2196  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.94 
 
 
162 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0294668  normal  0.4212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3570  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.94 
 
 
119 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2368  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.92 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.350476  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42523  predicted protein  31.25 
 
 
323 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1233  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.24 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2484  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.24 
 
 
104 aa  42  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.693469  normal  0.221304 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0884  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 
112 aa  42  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32820  predicted protein  36.11 
 
 
274 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0826  hypothetical protein  38.24 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2444  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000094626  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0647  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.31 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3624  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.67 
 
 
104 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1795  hypothetical protein  33.85 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1934  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.39 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0563  hypothetical protein  32.35 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2291  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
104 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29935  normal  0.0503314 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>