78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3811 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3811  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
124 aa  251  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00303345  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0912  antibiotic biosynthesis monooxygenase  64.08 
 
 
143 aa  159  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563989  normal  0.186238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8033  hypothetical protein  65.85 
 
 
124 aa  158  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0870707  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2807  antibiotic biosynthesis monooxygenase  66.12 
 
 
114 aa  150  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3540  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.16 
 
 
120 aa  136  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0441124  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0619  hypothetical protein  57.76 
 
 
112 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0668508  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3524  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.56 
 
 
124 aa  127  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187427  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3958  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09590  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  47.01 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32308  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3377  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.74 
 
 
110 aa  94.4  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000506782  hitchhiker  0.000558279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0960  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.09 
 
 
102 aa  88.6  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.710759  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35390  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  42.5 
 
 
99 aa  87.8  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0205  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.32 
 
 
119 aa  84  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.776817  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13625  hypothetical protein  42.24 
 
 
105 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57059e-29  hitchhiker  0.00966877 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1347  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
99 aa  80.1  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516596  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5352  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.53 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6639  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.35 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4837  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.53 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5137  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.53 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.72056  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4751  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.53 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0111986  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30250  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  59.09 
 
 
94 aa  77  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0586  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.82 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10750  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  39.82 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.857641 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0984  hypothetical protein  33.63 
 
 
167 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0234  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.61 
 
 
98 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.392876 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17660  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  42.86 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188096  normal  0.806629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0339  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.54 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1068  hypothetical protein  32.74 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0982  hypothetical protein  32.74 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0997  hypothetical protein  32.74 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1228  hypothetical protein  38.64 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1101  hypothetical protein  38.64 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1150  hypothetical protein  38.64 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4204  hypothetical protein  31.86 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1165  hypothetical protein  38.64 
 
 
165 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0822  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.37 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0987  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0274  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.43 
 
 
98 aa  63.5  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4367  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.47 
 
 
119 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3570  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.71 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2288  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787816 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0647  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.67 
 
 
166 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2662  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  36.36 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2368  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.78 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.350476  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0884  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
112 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2196  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 
162 aa  54.7  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0294668  normal  0.4212 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1380  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.56 
 
 
102 aa  53.5  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3305  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.14 
 
 
120 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.934506  hitchhiker  0.000279112 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2488  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3455  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
101 aa  52  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100306  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.88 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100568  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2173  hypothetical protein  30.86 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3263  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.63 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.310801 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0563  hypothetical protein  32.32 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2444  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000094626  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2632  hypothetical protein  27.27 
 
 
159 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2686  hypothetical protein  27.27 
 
 
159 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1433  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798713  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3012  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3624  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.29 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1632  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.16 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2170  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00297448  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2029  hypothetical protein  30.34 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42523  predicted protein  30.67 
 
 
323 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1600  monooxygenase  30 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.299485  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2137  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.6 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149356  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1934  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 
106 aa  42  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1042  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.72 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0514352 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2732  hypothetical protein  26.97 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1169  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.67 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1314  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.46 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2416  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.03 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4370  heme-degrading monooxygenase IsdG  38.33 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2457  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.05 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.608151  normal  0.197071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2161  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.38 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0156  heme-degrading monooxygenase IsdI  32.47 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0151  heme-degrading monooxygenase IsdI  32.47 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4034  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.312293  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>