75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1347 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1347  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
99 aa  195  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516596  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35390  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  71.43 
 
 
99 aa  149  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13625  hypothetical protein  76.6 
 
 
105 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57059e-29  hitchhiker  0.00966877 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0960  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  69.39 
 
 
102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.710759  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5352  antibiotic biosynthesis monooxygenase  72.34 
 
 
117 aa  141  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0339  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  69.39 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5137  antibiotic biosynthesis monooxygenase  72.34 
 
 
109 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.72056  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4837  antibiotic biosynthesis monooxygenase  72.34 
 
 
109 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4751  antibiotic biosynthesis monooxygenase  72.34 
 
 
109 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0111986  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10750  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  66.98 
 
 
109 aa  136  7.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.857641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0586  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  63 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09590  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  66.67 
 
 
101 aa  122  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32308  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0205  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.7 
 
 
119 aa  104  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.776817  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3958  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.02 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30250  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  50.54 
 
 
94 aa  89.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3524  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.72 
 
 
124 aa  88.6  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187427  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0619  hypothetical protein  45.1 
 
 
112 aa  89  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0668508  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2807  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.95 
 
 
114 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8033  hypothetical protein  42.37 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0870707  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3811  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00303345  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3540  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.23 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0441124  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0234  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.82 
 
 
98 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.392876 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0274  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.82 
 
 
98 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17660  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  40.16 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188096  normal  0.806629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0912  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.28 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563989  normal  0.186238 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.21 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100568  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3377  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000506782  hitchhiker  0.000558279 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2488  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.76 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3455  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.67 
 
 
101 aa  61.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100306  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4204  hypothetical protein  31.82 
 
 
165 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0822  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.94 
 
 
157 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1101  hypothetical protein  40.62 
 
 
165 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1228  hypothetical protein  40.62 
 
 
165 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1165  hypothetical protein  40.62 
 
 
165 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0987  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.62 
 
 
169 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1150  hypothetical protein  40.62 
 
 
165 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0997  hypothetical protein  40.62 
 
 
167 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0982  hypothetical protein  40.62 
 
 
167 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1068  hypothetical protein  40.62 
 
 
167 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0984  hypothetical protein  39.06 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6639  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0647  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.73 
 
 
166 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0884  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1380  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.19 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4367  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.63 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2662  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  37.5 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2288  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4666  heme-degrading monooxygenase IsdG  34.94 
 
 
107 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4437  heme-degrading monooxygenase IsdG  34.94 
 
 
107 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000517325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4656  heme-degrading monooxygenase IsdG  34.94 
 
 
107 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4669  heme-degrading monooxygenase IsdG  34.94 
 
 
107 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4287  heme-degrading monooxygenase IsdG  34.94 
 
 
107 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00056068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4782  heme-degrading monooxygenase IsdG  34.94 
 
 
107 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4651  heme-degrading monooxygenase IsdG  33.73 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0586  heme-degrading monooxygenase IsdG  33.73 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32820  predicted protein  37.21 
 
 
274 aa  51.2  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2196  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.67 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0294668  normal  0.4212 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4276  heme-degrading monooxygenase IsdG  33.73 
 
 
107 aa  50.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.089911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4370  heme-degrading monooxygenase IsdG  32.53 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2368  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.52 
 
 
106 aa  47.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.350476  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2686  hypothetical protein  27.94 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2444  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000094626  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3570  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.52 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2632  hypothetical protein  27.94 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2173  hypothetical protein  29.73 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3305  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
120 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.934506  hitchhiker  0.000279112 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3012  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.31 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1233  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1795  hypothetical protein  32.99 
 
 
106 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42523  predicted protein  29.35 
 
 
323 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0563  hypothetical protein  33.01 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2732  hypothetical protein  29.7 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2170  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.66 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00297448  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4190  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.48 
 
 
111 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269641  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2745  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.68 
 
 
112 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.583334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>