72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1974 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1974  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 112 aa  233  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2416  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  80.18 
 
 		 110 aa  187  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2355  antibiotic biosynthesis monooxygenase  78.57 
 
 		 138 aa  187  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0493653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0161  antibiotic biosynthesis monooxygenase  77.68 
 
 		 111 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2325  antibiotic biosynthesis monooxygenase  75.89 
 
 		 111 aa  183  8e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0149845  normal  0.743995 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6540  antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.46 
 
 		 104 aa  147  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.463782  normal  0.525958 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6066  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  60.38 
 
 		 104 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0493901 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2291  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.54 
 
 		 104 aa  141  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29935  normal  0.0503314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1795  hypothetical protein  64.36 
 
 		 106 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3126  antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.66 
 
 		 115 aa  133  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.312159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1042  antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.65 
 
 		 111 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0972  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.69 
 
 		 111 aa  130  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1169  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.69 
 
 		 111 aa  130  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2161  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.05 
 
 		 109 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1934  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.84 
 
 		 106 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2457  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.85 
 
 		 110 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.608151  normal  0.197071 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2745  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.05 
 
 		 112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1314  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.73 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2732  hypothetical protein  53.45 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4190  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.85 
 
 		 111 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269641  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3624  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.92 
 
 		 104 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1433  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.92 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798713  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2403  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.96 
 
 		 100 aa  111  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.661778 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3012  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.92 
 
 		 104 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2484  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 		 104 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.693469  normal  0.221304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0826  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0563  hypothetical protein  50.96 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00050  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  51.96 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3263  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.92 
 
 		 104 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.310801 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1600  monooxygenase  46.6 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.299485  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2137  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149356  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3445  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2922  decreased coverage  0.000158431 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.12 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4034  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.02 
 
 		 100 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.312293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2308  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48 
 
 		 102 aa  99.4  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1473  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.12 
 
 		 101 aa  97.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0472  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.63 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1632  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32820  predicted protein  41 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2444  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.64 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000094626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2170  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.64 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00297448  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2368  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.25 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.350476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2196  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.46 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0294668  normal  0.4212 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2662  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  40.79 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.94 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2288  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.79 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000787816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3305  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.51 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.934506  hitchhiker  0.000279112 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2488  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.96 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0619  hypothetical protein  36.59 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0668508  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4367  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3570  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3524  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.15 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0884  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.59 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1380  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.96 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3455  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.15 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100306  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42523  predicted protein  31.52 
 
 		 323 aa  52.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17660  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  34.52 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188096  normal  0.806629 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30250  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  38.46 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1233  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.47 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2632  hypothetical protein  27.27 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2686  hypothetical protein  27.27 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2173  hypothetical protein  28.75 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5137  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.72056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3958  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.45 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0156  heme-degrading monooxygenase IsdI  30.34 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4751  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0111986  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0151  heme-degrading monooxygenase IsdI  30.34 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4837  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0162  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.85 
 
 		 106 aa  40.4  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000571541  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0671  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.11 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09590  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  29 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32308  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6639  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.22 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>