60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0972 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0972  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
111 aa  231  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1169  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  92.79 
 
 
111 aa  222  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1042  antibiotic biosynthesis monooxygenase  91.89 
 
 
111 aa  220  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0514352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3126  antibiotic biosynthesis monooxygenase  89.22 
 
 
115 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.312159  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2457  antibiotic biosynthesis monooxygenase  83.5 
 
 
110 aa  189  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.608151  normal  0.197071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2161  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  81.13 
 
 
109 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1795  hypothetical protein  71.57 
 
 
106 aa  150  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2745  antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.46 
 
 
112 aa  146  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1314  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  65.38 
 
 
107 aa  146  9e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6066  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  62.14 
 
 
104 aa  138  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0493901 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2291  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  62.14 
 
 
104 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29935  normal  0.0503314 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6540  antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.46 
 
 
104 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.463782  normal  0.525958 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2325  antibiotic biosynthesis monooxygenase  62.14 
 
 
111 aa  136  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0149845  normal  0.743995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0161  antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.22 
 
 
111 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2416  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.22 
 
 
110 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2355  antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.56 
 
 
138 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0493653  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1974  antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.69 
 
 
112 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129762  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1433  antibiotic biosynthesis monooxygenase  62.75 
 
 
104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798713  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3624  antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.37 
 
 
104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1934  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  61 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0563  hypothetical protein  62.38 
 
 
104 aa  125  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3445  antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.41 
 
 
108 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2922  decreased coverage  0.000158431 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2137  antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.69 
 
 
104 aa  122  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149356  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2732  hypothetical protein  56.57 
 
 
113 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3012  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.92 
 
 
104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4190  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.52 
 
 
111 aa  110  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269641  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3263  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.96 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.310801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2308  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.02 
 
 
102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274785 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1600  monooxygenase  48.54 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.299485  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2484  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.51 
 
 
104 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.693469  normal  0.221304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2403  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.52 
 
 
100 aa  107  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.661778 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0826  hypothetical protein  49.51 
 
 
104 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4034  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.48 
 
 
100 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.312293  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.14 
 
 
104 aa  96.7  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309301  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00050  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  49.5 
 
 
101 aa  95.9  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1473  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.06 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0472  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.04 
 
 
102 aa  93.6  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1632  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.32 
 
 
100 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3455  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38 
 
 
101 aa  62  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100306  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42523  predicted protein  34.78 
 
 
323 aa  61.2  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32820  predicted protein  34.23 
 
 
274 aa  60.8  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2368  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.62 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.350476  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3305  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.19 
 
 
120 aa  58.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.934506  hitchhiker  0.000279112 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2444  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.24 
 
 
109 aa  57  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000094626  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2170  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.38 
 
 
112 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00297448  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3570  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.64 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4367  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.64 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 
104 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100568  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2196  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.71 
 
 
162 aa  51.6  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0294668  normal  0.4212 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0162  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.09 
 
 
106 aa  47.4  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000571541  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0884  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.84 
 
 
112 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1380  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.3 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8033  hypothetical protein  32.47 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0870707  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2807  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0151  heme-degrading monooxygenase IsdI  32.5 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3540  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.67 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0441124  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0156  heme-degrading monooxygenase IsdI  32.5 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2662  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  31.76 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2288  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3524  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.87 
 
 
124 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187427  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>