58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2332 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 104 aa  217  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1433  antibiotic biosynthesis monooxygenase  65.38 
 
 		 104 aa  148  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798713  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3624  antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.54 
 
 		 104 aa  140  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3012  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  62.5 
 
 		 104 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0563  hypothetical protein  58.25 
 
 		 104 aa  135  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3263  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  60.19 
 
 		 104 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.310801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1795  hypothetical protein  57 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2484  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.43 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.693469  normal  0.221304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0826  hypothetical protein  52.43 
 
 		 104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6066  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.37 
 
 		 104 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0493901 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2745  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.94 
 
 		 112 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2291  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.4 
 
 		 104 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29935  normal  0.0503314 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2732  hypothetical protein  50.5 
 
 		 113 aa  114  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6540  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.4 
 
 		 104 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.463782  normal  0.525958 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1314  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.94 
 
 		 107 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2403  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.5 
 
 		 100 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.661778 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1934  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.92 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0161  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.49 
 
 		 111 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2416  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.57 
 
 		 110 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2355  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.54 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0493653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1974  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.12 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3126  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.08 
 
 		 115 aa  100  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.312159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2325  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.52 
 
 		 111 aa  100  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0149845  normal  0.743995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2137  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.08 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149356  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4190  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.51 
 
 		 111 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269641  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1473  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.06 
 
 		 101 aa  99.4  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2308  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.88 
 
 		 102 aa  98.6  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1042  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.1 
 
 		 111 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0972  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.14 
 
 		 111 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1600  monooxygenase  44.12 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.299485  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1169  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.12 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00050  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  47.06 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2457  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.1 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.608151  normal  0.197071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2161  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.1 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4034  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.57 
 
 		 100 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.312293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0472  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.59 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3445  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.21 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2922  decreased coverage  0.000158431 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1632  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.63 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32820  predicted protein  43.88 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.69 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2368  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.27 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.350476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1380  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.63 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3455  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.07 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100306  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42523  predicted protein  35.9 
 
 		 323 aa  57.4  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0884  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2196  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.68 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0294668  normal  0.4212 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2488  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.37 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3305  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.39 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.934506  hitchhiker  0.000279112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4367  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.39 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2444  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.72 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000094626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3570  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.43 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2632  hypothetical protein  26.51 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2686  hypothetical protein  26.51 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2170  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.74 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00297448  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2662  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  32.5 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2288  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.5 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000787816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3958  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0162  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.25 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000571541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>