49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3445 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3445  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
108 aa  215  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2922  decreased coverage  0.000158431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1042  antibiotic biosynthesis monooxygenase  62.38 
 
 
111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0514352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1169  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  62.38 
 
 
111 aa  124  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2161  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  62.63 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2457  antibiotic biosynthesis monooxygenase  60.19 
 
 
110 aa  124  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.608151  normal  0.197071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0972  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.41 
 
 
111 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3126  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.86 
 
 
115 aa  117  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.312159  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1314  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.1 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2745  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53 
 
 
112 aa  114  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1795  hypothetical protein  56.57 
 
 
106 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6540  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.463782  normal  0.525958 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2416  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.43 
 
 
110 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0161  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.38 
 
 
111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2291  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  51 
 
 
104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29935  normal  0.0503314 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2325  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.53 
 
 
111 aa  107  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0149845  normal  0.743995 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6066  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 
104 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0493901 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2355  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.53 
 
 
138 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0493653  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1974  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49 
 
 
112 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129762  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1934  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.73 
 
 
106 aa  99.4  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0826  hypothetical protein  47.47 
 
 
104 aa  88.6  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2732  hypothetical protein  47.37 
 
 
113 aa  87.8  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2484  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.46 
 
 
104 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.693469  normal  0.221304 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4190  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46 
 
 
111 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269641  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1433  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.45 
 
 
104 aa  84  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798713  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0563  hypothetical protein  46.39 
 
 
104 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3624  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.36 
 
 
104 aa  82  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2137  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44 
 
 
104 aa  80.9  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149356  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2308  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.67 
 
 
102 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00050  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  48.45 
 
 
101 aa  80.1  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2403  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.32 
 
 
100 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.661778 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3012  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.27 
 
 
104 aa  77  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1600  monooxygenase  47.95 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.299485  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3263  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.310801 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4034  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.21 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.312293  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.21 
 
 
104 aa  72  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309301  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0472  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.68 
 
 
102 aa  70.1  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1473  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.24 
 
 
101 aa  70.1  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1632  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.42 
 
 
100 aa  57.8  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32820  predicted protein  36.45 
 
 
274 aa  52  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3570  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.65 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3455  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100306  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4367  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.14 
 
 
119 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3305  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.1 
 
 
120 aa  46.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.934506  hitchhiker  0.000279112 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2368  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.46 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.350476  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2196  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.82 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0294668  normal  0.4212 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1380  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.11 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0884  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.27 
 
 
112 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42523  predicted protein  30.77 
 
 
323 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100568  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>