70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35390 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_35390  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
99 aa  202  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0960  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  75.76 
 
 
102 aa  157  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.710759  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1347  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  71.43 
 
 
99 aa  149  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516596  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5352  antibiotic biosynthesis monooxygenase  76.09 
 
 
117 aa  148  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13625  hypothetical protein  73.91 
 
 
105 aa  143  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57059e-29  hitchhiker  0.00966877 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5137  antibiotic biosynthesis monooxygenase  72.83 
 
 
109 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.72056  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4837  antibiotic biosynthesis monooxygenase  72.83 
 
 
109 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4751  antibiotic biosynthesis monooxygenase  72.83 
 
 
109 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0111986  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0339  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  70.41 
 
 
103 aa  140  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0586  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  66.04 
 
 
108 aa  137  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09590  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  70.53 
 
 
101 aa  130  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32308  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10750  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  66.67 
 
 
109 aa  130  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.857641 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0205  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.17 
 
 
119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.776817  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30250  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  54.35 
 
 
94 aa  98.6  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0619  hypothetical protein  47.06 
 
 
112 aa  94  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0668508  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3524  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 
124 aa  90.1  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187427  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3811  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.5 
 
 
124 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00303345  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2807  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.3 
 
 
114 aa  87.8  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3958  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.52 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8033  hypothetical protein  42.02 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0870707  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3540  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.48 
 
 
120 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0441124  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17660  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  51.81 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188096  normal  0.806629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0912  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.25 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563989  normal  0.186238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0274  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.11 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3377  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000506782  hitchhiker  0.000558279 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0234  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.08 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.392876 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2488  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6639  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.56 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3455  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.69 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100306  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0822  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.15 
 
 
157 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2444  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.37 
 
 
109 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000094626  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1165  hypothetical protein  33.77 
 
 
165 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.17 
 
 
104 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100568  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1068  hypothetical protein  32.47 
 
 
167 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0997  hypothetical protein  32.47 
 
 
167 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1150  hypothetical protein  32.47 
 
 
165 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4204  hypothetical protein  32.47 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0982  hypothetical protein  32.47 
 
 
167 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1101  hypothetical protein  32.05 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1228  hypothetical protein  32.47 
 
 
165 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0987  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.47 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3305  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.28 
 
 
120 aa  55.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.934506  hitchhiker  0.000279112 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0647  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.38 
 
 
166 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4367  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.85 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0984  hypothetical protein  31.17 
 
 
167 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2288  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.89 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787816 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2662  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  38.89 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2196  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.89 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0294668  normal  0.4212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3570  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 
119 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4276  heme-degrading monooxygenase IsdG  32.29 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.089911  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0884  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.46 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4666  heme-degrading monooxygenase IsdG  32.89 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975251  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4656  heme-degrading monooxygenase IsdG  32.89 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4437  heme-degrading monooxygenase IsdG  32.89 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000517325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4669  heme-degrading monooxygenase IsdG  32.89 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4287  heme-degrading monooxygenase IsdG  32.89 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00056068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4782  heme-degrading monooxygenase IsdG  32.89 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2368  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.44 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.350476  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2170  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 
112 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00297448  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0586  heme-degrading monooxygenase IsdG  32.91 
 
 
107 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32820  predicted protein  36.14 
 
 
274 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4651  heme-degrading monooxygenase IsdG  32.91 
 
 
107 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42523  predicted protein  34.83 
 
 
323 aa  47.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1380  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.39 
 
 
102 aa  47  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4370  heme-degrading monooxygenase IsdG  31.65 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1233  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.14 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2632  hypothetical protein  25.56 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2686  hypothetical protein  25.56 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1473  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.63 
 
 
101 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2416  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.69 
 
 
110 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>