More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3348 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3348  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
277 aa  538  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3146  pyrroline-5-carboxylate reductase  83.39 
 
 
277 aa  440  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363144 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.25 
 
 
276 aa  193  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18050  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.45 
 
 
276 aa  193  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.96 
 
 
264 aa  188  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.15 
 
 
267 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0610  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.48 
 
 
267 aa  186  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0436215 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.11 
 
 
270 aa  185  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.4 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.2 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3276  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.62 
 
 
274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215376  hitchhiker  0.00496059 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0399  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.34 
 
 
274 aa  182  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.65 
 
 
272 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.69 
 
 
267 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.52 
 
 
264 aa  178  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.86 
 
 
272 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.49 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.49 
 
 
272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.85 
 
 
274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.36 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.82 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.87 
 
 
264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.27 
 
 
273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.38 
 
 
274 aa  172  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0660  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.39 
 
 
271 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.22 
 
 
272 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
267 aa  170  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.01 
 
 
274 aa  170  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.64 
 
 
273 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.03 
 
 
276 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.59 
 
 
285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.61 
 
 
276 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.4 
 
 
279 aa  165  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.99 
 
 
272 aa  165  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8353  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.76 
 
 
268 aa  165  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.04 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.41 
 
 
270 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2581  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.45 
 
 
272 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0897618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2500  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 
267 aa  158  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000695337  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1003  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.47 
 
 
281 aa  158  9e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.35 
 
 
282 aa  158  9e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.91 
 
 
282 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.18 
 
 
271 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.18 
 
 
272 aa  155  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0681  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.82 
 
 
294 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128651  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0661  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.82 
 
 
294 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.73 
 
 
273 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0668  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.82 
 
 
294 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.85 
 
 
277 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.57 
 
 
280 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.18 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.45 
 
 
274 aa  152  5e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.45 
 
 
274 aa  152  7e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.53 
 
 
276 aa  151  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4045  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.25 
 
 
279 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4160  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.25 
 
 
279 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4359  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.25 
 
 
279 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.07 
 
 
270 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.07 
 
 
285 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.86 
 
 
274 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6140  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.39 
 
 
297 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179161  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.36 
 
 
275 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.47 
 
 
274 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.28 
 
 
280 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.55 
 
 
267 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.6 
 
 
274 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.53 
 
 
272 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.09 
 
 
272 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.38 
 
 
277 aa  149  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3664  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.22 
 
 
273 aa  149  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3266  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.53 
 
 
272 aa  149  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.674816  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1990  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.63 
 
 
268 aa  149  7e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.307416  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 
270 aa  149  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.9 
 
 
271 aa  148  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.59 
 
 
282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24360  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.85 
 
 
289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.56 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.75 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.36 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.69 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  33.22 
 
 
283 aa  146  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.25 
 
 
273 aa  146  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.47 
 
 
263 aa  146  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000279105  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3883  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.16 
 
 
279 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.73 
 
 
272 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
272 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.65 
 
 
272 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.45 
 
 
275 aa  146  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.51 
 
 
293 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.07 
 
 
267 aa  145  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.73 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3496  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.16 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231373  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.55 
 
 
270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.03 
 
 
270 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.66 
 
 
279 aa  145  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.97 
 
 
271 aa  145  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
266 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>