280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1268 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1313  major facilitator superfamily MFS_1  90.43 
 
 		 491 aa  847    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000040275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1268  major facilitator transporter  100 
 
 		 470 aa  929    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0770735  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2802  major facilitator superfamily MFS_1  56.29 
 
 		 476 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1330  major facilitator superfamily MFS_1  55.19 
 
 		 469 aa  451  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1769  major facilitator superfamily MFS_1  54.87 
 
 		 475 aa  433  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00234233  hitchhiker  0.00662065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3865  nitrite transporter  51.53 
 
 		 455 aa  425  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2362  major facilitator superfamily MFS_1  51.85 
 
 		 458 aa  421  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.165332  normal  0.523677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4255  nitrite transporter  51.24 
 
 		 456 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.823889  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10271  integral membrane nitrite extrusion protein narU (nitrite facilitator)  50 
 
 		 463 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0502374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3492  nitrite transporter  49.58 
 
 		 467 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522254  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1822  major facilitator superfamily MFS_1  55.17 
 
 		 440 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.679534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0837  major facilitator superfamily MFS_1  48.44 
 
 		 450 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.738269  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0349  major facilitator transporter  44.86 
 
 		 502 aa  371  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11926  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2237  nitrite transporter  46.09 
 
 		 472 aa  360  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5927  nitrite extrusion protein  49.55 
 
 		 440 aa  360  4e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0123959 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0334  nitrate transporter  44.2 
 
 		 475 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000163846 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0604  MFS nitrate/nitrite transporter NarK  43.42 
 
 		 459 aa  350  4e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2725  major facilitator superfamily MFS_1  49.89 
 
 		 457 aa  349  5e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.30884  normal  0.0909618 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2417  major facilitator superfamily MFS_1  44.69 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000388918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5001  nitrate transporter  42.64 
 
 		 461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0909431  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0665  nitrite transporter  42.08 
 
 		 460 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1775  nitrite transporter  44.54 
 
 		 475 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610965  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1704  nitrite transporter  44.1 
 
 		 475 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0932912  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1768  nitrite transporter  43.17 
 
 		 468 aa  340  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2174  nitrate transporter  44.25 
 
 		 475 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.642939  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  43.14 
 
 		 905 aa  337  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0254  major facilitator transporter  45.2 
 
 		 464 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.78177 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0264  major facilitator transporter  45.2 
 
 		 464 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0274  major facilitator transporter  45.2 
 
 		 464 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13770  nitrite extrusion protein 2  44.03 
 
 		 468 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2166  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 		 461 aa  335  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.0459407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1233  nitrite extrusion protein 2  43.82 
 
 		 468 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  39.51 
 
 		 912 aa  331  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2657  nitrite transporter  43.86 
 
 		 457 aa  329  7e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0208  nitrite transporter  44.74 
 
 		 457 aa  325  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  42.36 
 
 		 893 aa  324  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3863  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 477 aa  323  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3044  major facilitator superfamily MFS_1  45.47 
 
 		 461 aa  323  4e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0440547  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2247  major facilitator superfamily MFS_1  42.41 
 
 		 469 aa  322  9.000000000000001e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00033016  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  41.59 
 
 		 895 aa  321  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2679  nitrite extrusion protein  43.01 
 
 		 490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1855  nitrate/nitrite transporter NarK  43.51 
 
 		 461 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2623  nitrite extrusion protein  43.01 
 
 		 490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2755  nitrate/nitrite transporter NarK  43.72 
 
 		 461 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1850  nitrite transporter  43.39 
 
 		 463 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2073  nitrate transporter  42.12 
 
 		 460 aa  319  7.999999999999999e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.741347  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2240  nitrite extrusion protein  42.8 
 
 		 490 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1730  nitrate/nitrite transporter NarK  43.51 
 
 		 461 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3079  nitrite extrusion protein  43.51 
 
 		 461 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1376  major facilitator superfamily MFS_1  43.43 
 
 		 470 aa  317  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0667515  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1512  nitrite extrusion protein  43.51 
 
 		 461 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.85958  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2316  nitrite transporter  40.72 
 
 		 465 aa  317  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.95434  normal  0.769623 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6183  cyclic nucleotide-binding protein  42.41 
 
 		 469 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0259908 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2566  nitrite transporter  40.08 
 
 		 462 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3015  nitrite extrusion protein  41.9 
 
 		 484 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.35043 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2260  nitrite transporter  40.08 
 
 		 462 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6173  major facilitator superfamily MFS_1  43.12 
 
 		 438 aa  312  7.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01201  nitrate/nitrite transporter  40.81 
 
 		 463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2422  nitrite transporter  40.81 
 
 		 463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2400  nitrite transporter  40.81 
 
 		 463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1707  nitrite extrusion protein 1  40.81 
 
 		 463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1333  nitrite extrusion protein 1  40.81 
 
 		 463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000558307  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1391  nitrite extrusion protein 1  40.81 
 
 		 463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00798499  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01211  hypothetical protein  40.81 
 
 		 463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1916  nitrite extrusion protein 1  40.81 
 
 		 463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184588  normal  0.196505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2225  nitrite transporter  40.48 
 
 		 472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190366  normal  0.0765968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2301  nitrite transporter  40.48 
 
 		 472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1374  nitrite extrusion protein 1  40.99 
 
 		 461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0787741  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0973  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  42.86 
 
 		 461 aa  307  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4667  nitrite transporter  42.86 
 
 		 461 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.885517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3590  nitrite transporter  42.86 
 
 		 461 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494502  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  44.27 
 
 		 917 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1558  nitrite extrusion protein 1  40.3 
 
 		 465 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431226  normal  0.0433169 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1315  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 460 aa  303  6.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1896  nitrite extrusion protein 1  40.3 
 
 		 465 aa  302  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0112468  normal  0.326955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1901  nitrite extrusion protein 1  40.3 
 
 		 465 aa  302  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0276869  normal  0.947736 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1960  nitrite extrusion protein 1  40.3 
 
 		 465 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0440291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2061  nitrite transporter  41.54 
 
 		 463 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0660  nitrite transporter  42.46 
 
 		 487 aa  301  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1375  nitrite extrusion protein 1  40.09 
 
 		 465 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0207934  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2898  nitrite transporter  41.56 
 
 		 462 aa  300  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1495  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 464 aa  299  8e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.078624 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1705  nitrite extrusion protein 2  42 
 
 		 462 aa  297  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0635768  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01427  nitrate/nitrite transporter  42 
 
 		 462 aa  296  4e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01439  hypothetical protein  42 
 
 		 462 aa  296  4e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1553  nitrite extrusion protein 2  41.78 
 
 		 462 aa  296  6e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.615088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2187  nitrite transporter  41.78 
 
 		 462 aa  296  6e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10265  integral membrane nitrite extrusion protein narK3 (nitrite facilitator)  42.54 
 
 		 469 aa  295  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.253592 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2178  nitrite transporter  41.56 
 
 		 462 aa  294  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2079  nitrite extrusion protein 2  41.78 
 
 		 462 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1650  nitrite extrusion protein 2  41.56 
 
 		 462 aa  293  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1108  nitrite transporter  42.74 
 
 		 486 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0426  nitrite transporter  42.68 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0435  nitrite transporter  42.68 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1585  nitrite extrusion protein 2  42.76 
 
 		 466 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1754  nitrite extrusion protein 2  42.54 
 
 		 466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.495939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1691  nitrite extrusion protein 2  42.54 
 
 		 462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1693  nitrite extrusion protein 2  42.32 
 
 		 466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.584294 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1766  nitrite extrusion protein 2  42.54 
 
 		 466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.408584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12352  nitrite extrusion protein 1 narK1 (nitrite facilitator 1)  38.68 
 
 		 515 aa  281  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>