More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2722 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2722  transport system permease protein  100 
 
 		 332 aa  585  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5109  iron-enterobactin transporter membrane protein  69.8 
 
 		 335 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.558445  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20810  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  69.28 
 
 		 339 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00921344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3785  transport system permease protein  68.33 
 
 		 336 aa  339  5e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000721562 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  47.37 
 
 		 358 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  49.5 
 
 		 374 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3730  transport system permease protein  42.01 
 
 		 350 aa  216  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4289  transport system permease protein  51.77 
 
 		 354 aa  206  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993131  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  42.9 
 
 		 348 aa  206  6e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.69 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  44.06 
 
 		 347 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1122  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.87 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.122202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36340  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  46.82 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0425  transport system permease protein  40 
 
 		 335 aa  197  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.639871 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00557  iron-enterobactin transporter subunit  45.87 
 
 		 334 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.87 
 
 		 334 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.87 
 
 		 334 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00546  hypothetical protein  45.87 
 
 		 334 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3054  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.87 
 
 		 334 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0644  transport system permease protein  43.52 
 
 		 342 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3036  transport system permease protein  45.21 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2818  transport system permease protein  47.45 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0492  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.54 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0675  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.54 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0641  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.54 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3424  iron-enterobactin transporter membrane protein  41.23 
 
 		 357 aa  192  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.320644  normal  0.302372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  44.34 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0338  ABC-type Fe3+-siderophore transport system inner membrane subunit  47.18 
 
 		 366 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552236  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5055  transport system permease protein  48.05 
 
 		 333 aa  188  9e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  41.01 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0645  iron-enterobactin transporter membrane protein  44 
 
 		 335 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.997729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0631  iron-enterobactin transporter membrane protein  44 
 
 		 335 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  42.24 
 
 		 341 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  40.24 
 
 		 350 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0750  iron-enterobactin transporter membrane protein  44 
 
 		 335 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0688  iron-enterobactin transporter membrane protein  44 
 
 		 335 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.690213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0704  iron-enterobactin transporter membrane protein  44 
 
 		 335 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  36.54 
 
 		 322 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  40.32 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  36.22 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  41.77 
 
 		 344 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06480  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  46.2 
 
 		 346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2591  transport system permease protein  40.97 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35861  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  45.45 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2748  transport system permease protein  45.48 
 
 		 335 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4040  transport system permease protein  41.39 
 
 		 344 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2553  transport system permease protein  47.85 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0828136  normal  0.763173 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  33.75 
 
 		 343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2206  transport system permease protein  46.45 
 
 		 344 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0665344  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  39.86 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  38.14 
 
 		 333 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  42.26 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  36.52 
 
 		 340 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  36.52 
 
 		 334 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  36.52 
 
 		 334 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0808  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuB  33.66 
 
 		 337 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0795  iron compound ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 		 337 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0863815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  36.52 
 
 		 334 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3528  transport system permease protein  42.21 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0903182  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  36.52 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  37.3 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2689  transport system permease protein  45.6 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0405482  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0356  transport system permease protein  43.79 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4083  transport system permease protein  38.55 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00175195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  36.18 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  41.78 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  39.94 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5947  transport system permease protein  42.72 
 
 		 362 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  34.43 
 
 		 336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  38.19 
 
 		 342 aa  166  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 		 338 aa  165  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  34.62 
 
 		 338 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  34.62 
 
 		 338 aa  165  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  34.62 
 
 		 338 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  34.62 
 
 		 338 aa  165  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2742  transport system permease protein  46.2 
 
 		 366 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00162968  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0851  transport system permease protein  40.42 
 
 		 351 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1623  transport system permease protein  43.61 
 
 		 354 aa  163  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  35.37 
 
 		 340 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  34.32 
 
 		 338 aa  162  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  34.62 
 
 		 338 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  33.13 
 
 		 350 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  33.73 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  33.12 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1807  transport system permease protein  40.82 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  33.73 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  36.86 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3934  transport system permease protein  41.09 
 
 		 352 aa  160  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3151  transport system permease protein  42.72 
 
 		 354 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00069111  hitchhiker  0.00000000474317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2172  transport system permease protein  42.44 
 
 		 349 aa  159  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0830561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  36.86 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  32.72 
 
 		 351 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  32.72 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  32.72 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2492  transport system permease protein  35.33 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.3582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  39.62 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  33.13 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  33.03 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  36.86 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>